中国辣椒AAT基因家族的鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 衡周

作者： 衡周;叶楚;方健敏;杨静;徐小万;徐晓美;李涛;王恒明

作者机构：

关键词： 中国辣椒;醇酰基转移酶;生物信息学;实时荧光定量PCR;基因鉴定;表达分析

期刊名称： 广东农业科学

ISSN： 1004-874X

年卷期： 2023 年 50 卷 011 期

页码： 39-49

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]中国辣椒(Capsicum chinense)是辣椒主要栽培种之一,种内多数品种的果实呈现由支链酯类物质形成的浓郁果香.醇酰基转移酶(Alcohol acyl-CoA transferase,AAT)催化支链酯类合成的最后一步反应,对支链酯类含量有重要影响.鉴定中国辣椒中AAT基因家族成员并分析其组织表达模式,可为其功能研究提供参考.[方法]通过生物信息学分析和实时荧光定量PCR对中国辣椒的AAT基因家族进行鉴定及表达特征分析.[结果]从中国辣椒基因组中鉴定到 10 个AAT基因,分布于 6 条染色体上,分别命名为CcAAT1-10.理化性质预测结果显示,AAT基因家族编码的氨基酸序列长度在 256~683 aa之间,分子质量范围为 29~77 kDa,等电点范围为 5.34~8.79,平均亲水系数均为负值,不稳定指数在 23.76~51.02 之间.蛋白质结构预测显示,CcAAT的二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,三级结构差异较大.亚细胞定位预测发现CcAAT均定位于细胞质中,其基因启动子上存在 16 种顺式调控元件.时空表达分析显示,CcAAT5、CcAAT6 在辣椒各器官中均未检测到表达,CcAAT8 在花和果实中特异表达,CcAAT1、CcAAT3、CcAAT7 在叶片中高表达,CcAAT4 在根系中高表达.[结论]明确了中国辣椒中AAT基因家族成员和表达模式,推测CcAAT8 可能是影响果实支链酯类物质含量的关键基因.

分类号： S641.3

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