龙眼Aux/IAA基因家族全基因组鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 梁钒

作者： 梁钒;张艺勇;张梦媛;方庭;郑少泉;曾黎辉

作者机构：

关键词： 龙眼;Aux/IAA基因家族;生物信息学;定量分析

期刊名称： 果树学报

ISSN： 1009-9980

年卷期： 2021 年 011 期

页码： 1839-1853

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】Aux/IAA作为重要的生长素原初响应因子参与到植物的各个生长发育阶段。为了解Aux/IAA家族基因在龙眼花芽分化过程中的作用,对DlIAA基因家族进行全基因组鉴定和分析,并研究其在外源激素处理下的表达模式。【方法】利用生物信息学方法对Aux/IAA基因家族进行全基因组鉴定与分析,基于RNA-seq数据库分析DlIAA基因家族的表达,利用qRT-PCR探究DlIAA基因家族在龙眼花芽分化过程中和外源IAA处理下的表达情况。【结果】利用龙眼参考基因组数据,鉴定出18个DlIAA基因,依据龙眼、苹果、拟南芥和番茄之间的系统发育关系,可将进化树分为4大类7个亚族。结果表明,DlIAA基因家族与苹果具有较高的同源性,而与拟南芥、番茄的亲缘关系较远。基因结构和结构域中同一类群的不同DlIAA基因家族成员具有较高的相似度。启动子中顺式元件的分布表明,DlIAA基因表达不仅受生长素（AuxREs、TGA-element和TGA-box）的调节,还受其他激素和生长环境的调节。DlIAA基因家族在龙眼9个不同组织中表现出不同的表达模式,且部分DlIAA基因为组织特异性基因。通过对不同品种龙眼花芽的3个RNA-seq数据库筛选发现,有5个候选基因（D1IAA2、D1IAA4、D1IAA7、D1IAA15和D1IAA17）均显示出较低的表达量,表明其功能与龙眼花芽分化可能存在一定的关系。进一步的qRT-PCR分析表明,DlIAA2和DlIAA17可能在开花诱导中起作用。DlIAA对外源IAA的反应结果表明,5个候选基因在100μmol·L-1IAA处理下被不同程度地诱导表达,且在500μmol·L-1浓度下均显著上调。【结论】转录组数据显示DlIAA基因参与了龙眼花芽分化过程,DlIAA2和DlIAA17可能在开花诱导中起作用。

分类号： S667.2

  • 相关文献

[1]油棕Aux/IAA基因家族鉴定与生物信息学分析. 杨蒙迪,金龙飞,周丽霞,窦雅静,曹红星,李新国. 2021

[2]粗山羊草全基因组Aux/IAA基因家族的分离、染色体定位及序列分析. 乔麟轶,李欣,畅志坚,张晓军,詹海仙,郭慧娟,李建波,常建忠,郑军. 2014

[3]无芒隐子草SAMS1基因的克隆及干旱胁迫下的表达分析. 孔令芳,张吉宇,刘志鹏,王彦荣. 2013

[4]龙眼体胚CDC48基因的克隆、原核表达及其在体胚发生过程中的表达分析. 陈义挺,赖钟雄,方智振,蔡英卿,林玉玲,李焕苓,陈登云. 2014

[5]龙眼GPX基因的克隆、原核表达及其在体胚发生过程中的表达分析. 陈义挺,赖钟雄,方智振,蔡英卿,林玉玲,李焕苓,陈登云. 2013

[6]龙眼果肉自溶相关基因DlMC4的克隆和表达分析. 谷李桃,帅良,罗焘,况梦玲,韩冬梅. 2017

[7]龙眼DELLAs基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析. 吴凯彤,黄石连,王静,李建光,郭栋梁. 2025

[8]近红外光谱法测定茶叶中游离氨基酸的研究. 郭志明. 2011

[9]气相色谱程序升温法测定风油精成分含量. 周敏. 2004

[10]青海共和盆地土地沙漠化影响因子的定量分析. 张登山. 2000

[11]芝麻中芝麻素酚三糖苷超声波辅助提取工艺研究. 高锦鸿,梅鸿献,汪学德,郑永战. 2016

[12]青海柴达木灌区春小麦增产途径分析. 姚有华,谢德庆,叶景秀. 2016

[13]41%乙蒜素原药样品的气相色谱定量分析. 霍红伟,陈增良. 2007

[14]25g/L五氟磺草胺可分散油悬浮剂的高效液相色谱测定方法. 刘敬民,李万芳,许霞,李明月. 2015

[15]高效液相色谱法测定乙蒜素的含量. 刘敬民,李万芳. 2014

[16]甲基吡嗯磷的高效液相色谱分析方法. 陈湘燕,段婷婷. 2006

[17]40%吡唑草胺悬浮剂高效液相色谱分析. 李汶锟,李明. 2010

[18]双草醚原药的高效液相色谱法研究. 刘敬民,李万芳,石隆平,林波,吴培. 2015

[19]故障树分析法在信息安全风险评估中的应用. 郑雷雷,宋丽华,郭锐,张建成. 2011

[20]溴氰虫酰胺原药的高效液相色谱法研究. 丛云波,石隆平,朱洪伟. 2016

作者其他论文 更多>>

微信小程序