2016年江苏省类猪圆环病毒P1分子流行病学回顾性调查

文献类型： 中文期刊

第一作者： 盛少阳

作者： 盛少阳;温立斌;茅爱华;朱雪姣;李彬;任子利;何孔旺

作者机构：

关键词： 类猪圆环病毒P1;序列分析;江苏

期刊名称： 畜牧与兽医

ISSN： 0529-5130

年卷期： 2019 年 03 期

页码： 97-100

收录情况： 北大核心

摘要： 旨在了解2016年江苏省类猪圆环病毒P1流行及毒株变异情况。运用PCR技术对江苏省9个县级市送检的330份血清进行检测,并进行全基因组测序,应用BioEdit和DNAStar对获得的P1全长基因组及ORF1与GenBank中的参考毒株进行序列比对及同源性分析,并进行系统进化树分析。共检出阳性样品43份,占总样品数的13%;9个地级市P1检出率差异显著,其中,沛县检出率最高为38.2%,其余各地0%～20%不等。选取9个县级市的代表毒株进行全基因组测序,共获得12株P1全长序列,12株毒株核苷酸同源性在99.4%～100%,ORF1核苷酸同源性在99.1%～100%;与参考毒株相比,ORF1核苷酸同源性在99.4%～100%,氨基酸同源性在99.1%～100%。研究表明,2016年江苏省各地区P1感染率差异显著,但整体感染率较高,毒株变异较小。

分类号： S852.651

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