引进陆地棉种质材料的遗传多样性、群体结构与连锁不平衡

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨洋

作者： 杨洋;马君;李波;胡文冉;王玉晶

作者机构：

关键词： 陆地棉;SSR;遗传多样性;群体结构;连锁不平衡

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2015 年 13 卷 06 期

页码： 1265-1275

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究利用121个分布于棉花全基因组的SSR标记,对187份国外棉花种质材料和31份新疆本地棉花品种进行遗传多样性、群体遗传结构和连锁不平衡分析。结果表明:218份材料共检测到284个SSR等位变异,等位基因变异数在2~9之间,遗传多样性指数平均为0.402,PIC值平均为0.355。基于STRUCTURE分析,218份材料可被划分为三个亚群(POP-1/2/3)。AMOVA分析表明,14.6%的变异来源于亚群间,85.4%的变异来源于亚群内。连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)分析显示,r2≥0.05(p<0.01)的条件下,10.18%的SSR位点组合存在显著的LD,整体LD水平不高,共线性位点间存在LD的比例高于非共线性位点,表明位点间的连锁对LD有重要影响。在r2=0.1时(p<0.05),LD最大遗传距离为34.7 c M,当r2=0.2时,LD最大遗传距离为9 c M。进一步对Chr.3、Chr.11、Chr.23和Chr.24共4个染色体的LD衰减距离进行分析,发现Chr.3和Chr.11具有较高的LD衰减距离。LD分析结果表明本研究群体可用于标记——性状关联分析,并且对单个染色体LD的评估将提供重要的参考。

分类号： S562

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