基因本体论在福氏志贺菌转录组研究中的应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 朱阵

作者： 朱阵;刘翠翠;王婧;张继瑜;魏小娟;周绪正;李冰;郭肖

作者机构：

关键词： RNA-seq;福氏志贺菌;转录组;基因本论

期刊名称： 西北农业学报

ISSN： 1004-1389

年卷期： 2014 年 23 卷 12 期

页码： 17-24

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用RNA-seq技术进行环丙沙星敏感和耐药的福氏志贺菌2457T株的序列测定与组装,对其碱基序列借助基因本体(Gene Ontology,GO)在生物进程、细胞组分、分子功能三方面进行注释和生物学分析。研究经过耐药诱导的转录组差异表达情况,并探讨差异表达基因在耐药性产生过程中的作用及相互关系。结果表明,通过耐药诱导有3 641个基因差异表达,其中961个GO条目注释到39个功能类别。同时发现硫酸盐、硝酸盐氧化还原相关酶系,电子/H+传导基因,膜转运蛋白,ABC外排泵家族4类耐药相关的功能基因组分。

分类号： Q78

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