甘薯褪绿矮化病毒西非株系实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王丽

作者： 王丽;王振东;乔奇;秦艳红;张德胜;田雨婷;王爽;张立军;张振臣

作者机构：

关键词： 甘薯褪绿矮化病毒西非株系;荧光探针;实时荧光定量PCR

期刊名称： 植物病理学报

ISSN： 0412-0914

年卷期： 2014 年 44 卷 05 期

页码： 461-468

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 依据Gen Bank中登录的甘薯褪绿矮化病毒(Sweet potato chlorotic stunt virus,SPCSV)西非株系(WA)的核苷酸序列,分别设计两对特异性引物和一条Taq Man探针。以SPCSV-WA外壳蛋白(cp)基因的重组质粒为阳性标准质粒绘制标准曲线,通过优化反应体系和反应条件,建立了SPCSV-WA的实时荧光定量PCR检测方法。试验结果表明,该方法只能检测到目的病毒,标准曲线的斜率和相关系数分别为-3.239和1,扩增效率为103.568%。最低可检测到约3.31 copies/μL的阳性质粒,灵敏度比常规PCR高1 000倍。本研究建立的SPCSV实时荧光定量PCR方法可用于田间样品的检测,为SPCSV的早期预警和流行学研究提供了技术手段。

分类号： S435.31

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