基于SLAF-seq的葡萄种质遗传关系分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张柯

作者： 张柯;尚泓泉;王彬;娄玉穗;吴文莹;樊红杰;郭红光;吕中伟

作者机构：

关键词： 简化基因组测序;SNP;种质鉴定

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2022 年 20 卷 020 期

页码： 6901-6911

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探明部分系谱不明的葡萄种质的遗传背景,利用简化基因组测序技术对23份鲜食葡萄种质进行遗传关系分析.共获得25.96 Gb高质量数据,开发了 715 776个SLAF标签,505092个多态性SLAF标签.基于456 776个高一致性的SNP,分析和构建了 23个葡萄种质的系统发育树.通过SNP聚类分析,23个葡萄种质聚为3大类.其中,同一种质的衍生品种、具有亲子代关系的品种及姊妹系品种各聚合在一类,血缘关系相近的欧亚种和欧美种聚合在一类.研究表明,简化基因组测序技术可以高效地开发出SNP标记、准确分析遗传关系.本研究通过SNP聚类分析为2份遗传背景不明的种质找到了亲缘关系最近的葡萄品种,为葡萄种质鉴定、资源保护和高效育种提供参考依据.

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