黄肉苹果转色期前后类胡萝卜素合成相关差异表达基因鉴定

文献类型： 中文期刊

第一作者： 宋成秀

作者： 宋成秀;张利义;张彩霞;田义;丛佩华

作者机构：

关键词： 苹果;黄肉;转录组;类胡萝卜素;MdCCD4

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2017 年 44 卷 02 期

页码： 205-214

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了了解黄肉苹果种质成熟时富集类胡萝卜素的分子机制,以黄肉种质‘东北黄海棠’为材料,选择转色期前后(盛花后90 d和115 d)两个发育时期的果实进行RNA-seq测序,分析两个样本差异表达基因,并利用实时荧光定量PCR技术验证获得的类胡萝卜素合成相关差异表达基因的表达水平。结果获得两个样本显著差异表达基因共3 056个,与盛花后90 d果实比较,成熟期果实中有1 270个基因上调表达,1 786个基因下调表达。对这些表达差异基因进行了Pathway富集分析,结果显示差异表达基因涉及类胡萝卜素、苯丙氨酸以及类黄酮等代谢途径,其中类胡萝卜素代谢途径基因有3个上调,4个下调。通过对这7个差异表达基因进一步的qRT-PCR及聚类分析,发现一个新的候选基因MdCCD4b,该基因与菊花以及桃等CCD4聚为一类,与其他作物功能已知的CCD4一样,其表达水平与黄肉种质中类胡萝卜素积累呈负相关,推测黄肉种质果实成熟后类胡萝卜素的富集与MdCCD4b基因显著下调有关。

分类号： S661.1

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