猪HMGA1基因的组织表达及其多态性与背膘厚的关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 巩建飞

作者： 巩建飞;岳静伟;赵玲玲;刘运鹏;王立贤;刘欣;孙金海

作者机构：

关键词： 猪;HMGA1基因;组织表达;SNP;背膘厚

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2019 年 7 期

页码： 1340-1346

摘要： 旨在探究HMGA1基因在猪不同组织、不同日龄下不同品种中的表达谱,并对该基因编码区及3′UTR区的多态性与猪背膘厚进行关联分析.本研究利用实时荧光定量PCR检测大白猪HMGA1基因在7种组织的表达情况,及其在60、150和210日龄大白猪和民猪背部脂肪中的差异表达.对576头大白猪*民猪F2代资源群体的基因组DNA重测序进行HMGA1序列分析,筛选其编码区及3′UTR区SNPs,并以屠宰体重为协变量与背膘厚(第6~7肋)进行关联分析.结果表明,HMGA1 mRNA在大白猪不同组织中均有表达,且在组织间存在显著差异(P<0.05),其中在肺中的表达量最高,而在心和肌肉中微量表达.在60和150日龄时,HMGA1基因在民猪背部脂肪中的表达量显著高于大白猪(P<0.05);210日龄时在两个猪种中的表达差异不显著(P>0.05).通过对F2群体HMGA1序列分析,在编码区检测出13个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,其中包含2个错义突变位点:g.3261G>A和g.5818G>A,且g.3261G>A位点与背膘厚显著关联(P<0.05).在3′UTR区检测到3个SNPs,且位于小RNA(microRNA, miRNA)结合靶点,其中g.7217G>C和g.7280T>C与背膘厚显著关联(P<0.05).研究结果表明,HMGA1作用于猪背部脂肪组织,且该基因g.3261G>A、g.7217G>C和g.7280T>C位点可作为猪背膘厚选育的潜在分子标记,为猪的分子育种奠定基础.

分类号： S828.2

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