湖羊卵巢不同发育阶段的miRNA鉴定与分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 解领丽
作者: 解领丽;李嫒;黄万龙;张秀秀;苗向阳
作者机构:
关键词: miRNA;卵巢;发育;功能注释;绵羊
期刊名称: 畜牧兽医学报
ISSN: 0366-6964
年卷期: 2019 年 7 期
页码: 1396-1404
摘要: 旨在分析不同发育阶段绵羊卵巢组织中miRNA的表达水平,了解miRNA表达及其调控机理.本研究采用转录组测序技术鉴定1和8月龄湖羊卵巢组织中的miRNA,运用生物信息学方法对差异表达的miRNA进行靶基因预测,并对靶基因进行GO和KEGG功能注释,筛选参与卵巢发育的miRNAs.结果显示,6个样品中检测到的已知miRNA个数分别为2 186、2 091、2 217、2 136、2 176、2 088,新miRNA的个数分别为613、567、668、640、662、450.筛选到701个差异表达novel miRNAs,38个差异表达已知miRNAs.对差异表达miRNAs的靶基因进行GO和KEGG分析,发现主要富集在血管内皮生长因子通路和卵巢类固醇生成等过程.对3个差异miRNAs进行qRT-PCR验证,与测序结果一致.oar-let-7b、oar-miR-29a、oar-miR-134-3p、oar-miR-541-3p等的靶基因富集在TGF-beta通路、卵巢卵泡生长等与卵巢发育相关的生物过程.oar-miR-148a、oar-miR-136的靶基因调控颗粒细胞增殖和类固醇生成,可能参与调控绵羊卵巢发育.
分类号: S826
- 相关文献
[1]五月龄翘嘴红鲌性腺组织小RNA转录谱的分析比较. 曹访,刘莉,采克俊,吴成龙,周俊波. 2020
[2]利用Solexa测序技术鉴定策勒黑羊microRNA. 曾献存,贾斌,史洪才,申红,张永生,陈韩英. 2016
[3]miRNA调控动物卵泡发育研究进展. 冯光杭,江声伟,李耀坤,柳广斌,邹娴,刘德武. 2021
[4]日本血吸虫Bantam miRNA靶基因Rho相关GTP结合蛋白对雌虫卵巢发育影响的分析. 李旭欣,夏天奇,李姗,Bikash Ranjan Giri,刘静宜,李舜,李雪,李慧民,杜鹏飞,程国锋. 2023
[5]广东鲂性腺发育组织学研究. 刘亚秋,李新辉,李跃飞,杨计平,徐田振. 2019
[6]巴什拜羊骨骼肌不同发育阶段差异表达miRNA研究. 张伟,王世银,邓双义,杨力伟,石国庆,甘尚权. 2018
[7]microRNA与植物花发育调控的研究进展. 徐妙云,王磊. 2011
[8]miRNA参与植物胚和胚乳发育调控的研究进展. 邢利娟,刘悦萍,王磊,徐妙云. 2020
[9]不同保存条件对绵羊卵巢组织卵泡存活的影响. 彭夏雨,陈童,汪立芹,郭志勤. 2010
[10]不同繁殖季节绵羊卵巢组织中piRNAs序列特征及表达差异分析. 张仁森,贺建宁,魏彩虹,梁小军,马青,狄冉,储明星. 2020
[11]成年绵羊不同组织中GPR 30 mRNA表达特性研究. 路佩瑶,曹宁贤,王福传,宋献艺,闫益波,高莉,赵英虎,张凯,张玉换. 2015
[12]不同类型绵羊胚胎体外发育率的比较研究. 潘晓燕,杨梅,王正朝,汪立琴,陈童,郭志勤,王锋. 2009
[13]单双羔绵羊卵巢组织差异表达microRNAs筛选. 祁云霞,刘晓芳,张萍,何小龙,邢玉梅,达赖,特日格勒,刘永斌,荣威恒. 2015
[14]miR-376b-5p调控绵羊产羔性状相关基因IGF1的表达. 李文韬,周丽娟,刘子嶷,王鹏,储明星,刘玉芳. 2023
[15]3个候选miRNA在不同光周期绵羊垂体中的表达及潜在功能预测. 刁婉莹,夏青,刘秋月,贺小云,储明星,狄冉. 2023
[16]绵羊卵丘细胞对裸卵体外成熟及孤雌发育影响的研究. 崔茂盛,张金龙,张效生,赵启立,冯建忠. 2012
[17]NaCl胁迫下黑果枸杞转录组测序分析. 马彦军,段慧荣,魏佳,Richard John Tiika,单立山,马瑞. 2020
[18]基于RNA-Seq的辣木叶转录组研究. 张雅玲,王小安,潘少霖,叶新福. 2017
[19]青梗花椰菜和白梗花椰菜转录组分析. 林珲,薛珠政,李永平,李大忠,刘建汀,朱海生,温庆放. 2018
[20]基于转录组测序技术的黄唇鱼SSR分子标记筛选. 赵彦花,区又君,温久福,李加儿,周慧. 2019
作者其他论文 更多>>
-
城市森林不同林分对空气负离子及臭氧浓度交互效应响应机制研究
作者:李少宁;李嫒;时聪;赵娜;徐晓天;郑立群;郭嘉兴;鲁绍伟
关键词:城市森林;不同林分;空气负离子;臭氧
-
莱芜猪肌内脂肪和皮下脂肪转录组分析
作者:冯卉;刘天义;SALSABEEL Yousuf;苗向阳
关键词:脂肪代谢;肌内脂肪(IMF);皮下脂肪(SCF);转录组测序;PCR验证
-
lncRNA在动物脂肪沉积中的研究进展
作者:刘天义;冯卉;SALSABEEL Yousuf;解领丽;苗向阳
关键词:长链非编码RNA;脂肪;分化;脂代谢
-
北京西山国家森林公园空气负离子与大气污染物关系研究
作者:李少宁;李嫒;赵旭;鲁绍伟;赵娜;徐晓天;徐兰
关键词:空气负离子;大气污染物;森林公园
-
北京西山国家森林公园中空气负离子浓度与气象因子的相关性研究
作者:李少宁;李嫒;鲁绍伟;张伟宁;徐兰;赵娜;徐晓天
关键词:北京西山国家森林公园;城市森林;空气负离子;气象因子;相关性
-
北京城市森林空气负离子与臭氧特征及相互作用
作者:李嫒;鲁绍伟;李少宁;赵娜;徐晓天
关键词:空气负离子;臭氧;时空变化;相互作用
-
多浪羊与小尾寒羊皮下脂肪组织转录组分析
作者:刘天义;冯卉;Salsabeel Yousuf;解领丽;苗向阳
关键词:mRNA;皮下脂肪;脂肪沉积;脂质代谢;绵羊