玉米CCT基因家族的鉴定与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郭栋

作者： 郭栋;杜媚;周宝元;高卓晗;曹哲统;赵明

作者机构：

关键词： 玉米;CCT;生物信息学分析;蛋白结构

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2019 年 4 期

页码： 1001-1010

摘要： CCT(CO、COL和TOC1)家族基因广泛参与植物花期的调控过程,对植物的生长与发育起着至关重要的作用.本研究以玉米为材料,共鉴定出57个CCT基因,命名为ZmCCT1~ZmCCT57,利用生物信息学方法开展玉米ZmCCTs基因的结构、氨基酸特点、染色体定位及基因进化分析,还与其他物种的CCT基因家族进行对比分析.结果表明,CCT基因家族在染色体上呈现不均匀分布,其中5号染色体分布最多(11个),3、7、10号等染色体分布最少(均只有3个).CCT基因家族具有相对保守的结构,即每个基因都包含保守的CCT DNA结构,其他少数基因含有其他DNA结构,CCT蛋白的3 D结构含有1个α螺旋与3个β折叠.根据多物种CCT蛋白的进化树分析依据相似性将其分为8个分支,分析结果显示单子叶植物玉米与谷子、二穗短柄草CCT基因保守性更强,亲缘关系更近.本研究为进一步揭示玉米CCT基因家族的功能机制提供了相应的参考.

分类号： S513

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