桃小食心虫CsasCSP14的基因克隆及分子对接

文献类型: 中文期刊

第一作者: 刘孝贺

作者: 刘孝贺;孙丽娜;佟兆国;张怀江;闫文涛;岳强;仇贵生

作者机构:

关键词: 桃小食心虫;CsasCSP14;基因克隆;分子对接;荧光定量

期刊名称: 应用昆虫学报

ISSN: 2095-1353

年卷期: 2021 年 003 期

页码: 643-654

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】本研究旨在获得桃小食心虫CarposinasasakiiMatsumuraCsasCSP14基因序列,分析其在雌雄不同组织中的表达差异,并与寄主挥发物进行分子对接,为该基因的功能研究提供参考。【方法】以桃小食心虫全组织cDNA为模板,通过PCR技术扩增克隆获得CsasCSP14 cDNA序列全长;利用生信分析软件分析其编码蛋白的理化性质和结构特征;通过荧光定量PCR技术分析CsasCSP14在桃小食心虫雌雄成虫不同组织(触角、头、胸、腹、足和翅)中的表达情况;使用Modeller(version 9.19)构建CsasCSP14蛋白的三维结构模型;运用Autodock 4.2将CsasCSP14与32种苹果挥发物和2种性信息素分子进行分子对接。【结果】克隆获得了桃小食心虫化学感受蛋白基因CsasCSP14的cDNA序列,其开放阅读框(Open reading frame,ORF)长度为369 bp,编码122个氨基酸,预测其蛋白分子量为14.13 ku,理论等电点为5.20,有17个氨基酸残基组成的信号肽序列,且18-122位氨基酸之间存在昆虫化学感受蛋白家族保守结构域;含有4个保守的半胱氨酸位点。CsasCSP14具有6个α螺旋;氨基酸同源比对结果显示,CsasCSP14与玉米螟Pyrausta nubilalis OfurCSP5的氨基酸序列一致性最高,达到79.01%。荧光定量PCR结果显示,CsasCSP14在雌雄成虫的触角、头、胸、腹、足和翅中均有表达,但是其表达丰度有差异,在雌雄成虫触角中的表达量最高。通过Modeller软件搜索CsasCSP14三维结构的模板,得到与沙漠蝗Schistocerca gregaria CSPsg4序列相似性为65.7%。因此以CSPsg4为模板成功构建CsasCSP14三维结构。分子对接结果表明CsasCSP14与2-己烯醛、桃醛、醋酸丁酯、庚醛、异戊醛和法尼烯气味分子结合能比较低,并且Leu-22、Phe-29、Phe-42和Ile-464个疏水性氨基酸残基在结合过程中发挥了关键作用。【结论】本研究为进一步了解桃小食心虫CsasCSP14基因功能和利用化学生态的方法防控该虫提供了前期理论基础。

分类号: S433.4

  • 相关文献

[1]桃小食心虫化学感受蛋白CSP16配体结合特性. 刘孝贺,仇贵生,佟兆国,张怀江,闫文涛,岳强,孙丽娜. 2021

[2]中华蜜蜂气味受体基因AcerOr167的克隆及表达分析. 杜亚丽,潘建芳,王树杰,杨爽,赵慧婷,姜玉锁. 2017

[3]橡胶草HMGR基因的克隆及表达分析. 王启超,刘实忠,校现周. 2012

[4]黄颡鱼DMRT1基因cDNA全长克隆及其表达分析. 李林,梁宏伟,李忠,罗相忠,张志伟,朱媛媛,邹桂伟. 2012

[5]花椒窄吉丁化学感受蛋白AzanCSP7的三维模型预测及其与寄主挥发物的分子对接. 高晓进,郭莉,陈迪,贾任航,张泽腾,谢寿安,吕淑杰. 2023

[6]荔枝蒂蛀虫卵5个化学感受蛋白的基因克隆及除虫脲对其表达的影响. 姚琼,全林发,聂晶,徐淑,李文景,董易之,陈炳旭. 2021

[7]小飞蓬捕光叶绿素结合蛋白基因CcLhca-J9克隆及表达分析. 李祖任,罗丁峰,柏浩东,徐晶晶,韩进财,徐强,王若仲,柏连阳. 2021

[8]桃小食心虫鱼尼丁受体基因克隆及表达模式分析. 张怀江,闫文涛,马春森,仇贵生. 2015

[9]桃小食心虫成虫化学感受蛋白CSPs的基因克隆及表达谱分析. 刘孝贺,孙丽娜,张怀江,闫文涛,岳强,仇贵生. 2020

[10]QRT-PCR检测目的基因mRNA转录水平的应用. 韩天龙,王敏,李志明. 2011

[11]棉花中一个新的类DREB转录因子(GhDREB2B)的克隆、序列特征及表达分析. 邱新棉,刘传亮. 2010

[12]冠突曲霉Fig基因敲除菌株的构建及表型分析. 刘逸梅,谭玉梅,王亚萍,刘作易. 2019

[13]“花山麻鸡”CPT1B基因时空表达特性研究. 屠云洁,束婧婷,巨晓军,刘一帆,章明,单艳菊,姬改革,邹剑敏. 2019

[14]大豆内源基因调控与籽粒不饱和脂肪酸的形成. 李丽丽,张雷,刘丽君,唐晓飞,杨喆. 2008

[15]狂犬病病毒G蛋白在水稻中的表达及遗传稳定性鉴定. 申雪静,张二芹,许倩茹,刘林科,万博,刘运超,孙亚宁,赵东,牛香香,邓瑞广,张改平. 2019

[16]牦牛Ihh 基因组织表达分析、SNP检测及其基因型组合与生产性状的关联分析. 李天科,赵娟花,裴杰,梁春年,郭宪,秦文,阎萍. 2015

[17]新型鸭呼肠孤病毒TaqMan探针实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立与应用. 张博,陈立功,武华,阴雅洁,孟利佳,郭康康,侯绍华,董世山. 2020

[18]一种适用于油菜、大豆、花生、芝麻四种油料作物种子的RNA提取方法. 孙海波,王智慧,刘学群,黄军艳,董彩华,刘胜毅. 2012

[19]甘薯淀粉合成相关酶基因的克隆与表达分析. 侯夫云,李丰,秦桢,李爱贤,董顺旭,王庆美,张立明. 2019

[20]蓝莓角鲨烯环氧化酶基因的克隆与表达分析. 陈新,徐丽,张力思,宗晓娟,魏海蓉,王甲威,谭钺,朱东姿,洪坡,刘庆忠. 2019

作者其他论文 更多>>