基于SSR标记的砂仁种质资源遗传多样性与群体结构分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李文秀1

作者： 李文秀1;李进良2;贺军军1,3;张华林1;罗萍1;魏滢4;赵美婷4

作者机构：

关键词： 砂仁;SSR分子标记;遗传多样性;聚类分析

期刊名称： 中国中药杂志

ISSN： 1001-5302

年卷期： 2022 年 017 期

页码： 4618-4626

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 砂仁为“四大南药”之一，其种质资源遗传背景复杂，探讨种质资源遗传多样性及亲缘关系，有利于理清砂仁种质来源和遗传背景，以便在砂仁亲本选配以及品种选育上提高效率。采用聚丙烯凝胶电泳技术，对收集的84份砂仁资源用71对SSR引物进行PCR扩增，筛选出54对多态性高的SSR引物，分析其遗传多样性。遗传多样性分析显示，54对SSR引物在84份材料中共出现293个等位基因，平均每对引物可检测到5.32个，变化范围为3～8个，其中AVL12标记等位基因数量最多；每个位点PIC值变化范围在0.068 7～0.828 9,均值为0.529 9,最高的为AVL24标记；不同来源地砂仁群体显示，云南群体遗传多样性最高，广西次之，广东最低。群体结构分析和聚类分析都将材料划分为2个类群。从来源地看，云南和广西两地材料亲缘关系较近，不同来源地的砂仁资源没有明显的分化。该研究利用54对SSR标记对84份种质资源材料的遗传多样性和群体结构进行分析，可反映不同种质来源和不同群体间的亲缘关系，从而为砂仁资源收集、研究和育种工作提供理论依据。

分类号： S567.239

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