鲤TRAP分子标记反应体系的建立与优化

文献类型: 中文期刊

第一作者: 曲疆奇

作者: 曲疆奇;苏胜彦;董在杰;明俊超;梁政远;袁新华

作者机构:

关键词: 鲤;TRAP标记;体系;优化

期刊名称: 动物学杂志

ISSN: 0250-3263

年卷期: 2010 年 45 卷 03 期

页码: 74-80

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 针对鲤(Cyprinus carpio)这一主要水产养殖品种设计了靶位区域扩增多态性(target region amplified polymorphism,TRAP)分子标记的反应体系,对影响TRAP反应体系的各参数,包括Mg2+、dNTPs、TaqDNA聚合酶、模板DNA和引物浓度进行了优化,建立了适合鲤的、稳定、可重复的TRAP-PCR反应体系。在15μlPCR反应体系中,Mg2+浓度为1.5mmol/L、dNTPs浓度为0.35mmol/L、两个随机引物浓度均为3pmol/L、固定引物浓度为10pmol/L、含DNA模板60ng、TaqDNA聚合酶1.0U。鲤的TRAP反应程序为:94℃4min,1个循环;94℃45s,35℃45s,72℃1min,5个循环;94℃45s,53℃45s,72℃1min,35个循环;72℃10min,1个循环。这一优化体系的建立为今后进行鲤群体遗传多样性、种质鉴定、遗传连锁图谱及亲缘关系分析等方面的研究提供了新的分子标记。

分类号: S917.4

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