海蜇(Rhopilema esculentum)Wnt5基因:cDNA克隆、基因组结构与表达

文献类型： 中文期刊

第一作者： 周春娅

作者： 周春娅;朱玲;潘滢;谢明松;杨傲傲;陈四清;庄志猛

作者机构：

关键词： 海蜇;Wnt5;cDNA;基因组结构;实时荧光定量PCR

期刊名称： 海洋与湖沼

ISSN： 0029-814X

年卷期： 2013 年 44 卷 04 期

页码： 1115-1122

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用转录组454 GS FLX测序和RACE技术,首次解析了海蜇Wnt5基因的cDNA和基因组结构。结果表明,Re-Wnt5基因的cDNA全长1647bp,其中编码区长1059bp,编码了353个氨基酸的多肽;Re-Wnt5基因组含有4个外显子和3个内含子。SMART分析表明,Re-Wnt5具有Wnt家族共同的结构特征,包括一个由20个氨基酸组成的信号肽,2个N-糖基化位点和24个保守的参与二硫键形成的半胱氨酸。多序列比对和系统进化分析表明,Re-Wnt5基因与来自刺胞动物、无脊椎动物和脊索动物的Wnt5、脊椎动物的Wnt5a和Wnt5b具有高度相似性,Wnt5a和Wnt5b两个进化分支发生在脊索动物文昌鱼之后。实时荧光定量PCR显示,Re-Wnt5基因在海蜇四个发育阶段均有表达,其中横裂体阶段的表达量最高,分别是螅状体、碟状体和水母体表达量的12.38、9.99和13.01倍。

分类号： S917.4

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