利用Y染色体SRY基因分析马鹿的父系起源和遗传多样性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 房瑞新

作者： 房瑞新;田雪琪;邹晨;董依萌;李洋;邢秀梅;刘欣

作者机构：

关键词： 马鹿;遗传多样性;父系起源;SRY基因

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN：

年卷期： 2021 年 007 期

页码： 2457-2466

收录情况： 北大核心

摘要： 试验旨在从分子水平上研究中国马鹿的父系起源结构和遗传多样性水平,判断各种群间的系统发育关系和亲缘关系远近。通过DNA提取、PCR扩增和直接测序的方法,对天山马鹿、阿尔泰马鹿、塔河马鹿、东北马鹿等11个群体共159头马鹿的SRY基因序列进行了检测和分析,计算碱基组成、核苷酸多样性（Pi）、单倍型多样性（Hd）以评估遗传多样性,构建单倍型网络图;以白唇鹿为外群,用邻接法（NJ）和最大似然法（ML）构建系统进化树,探讨马鹿的聚类及遗传多样性。结果显示,所获序列长度为1 615 bp,在基因中共鉴定出18个SNPs多态性位点,占核苷酸总数的1.11%,根据多态性位点鉴定出14个单倍型,优势单倍型为Hap-1,所占频率35.84%,为天山马鹿、阿尔泰马鹿、阿拉善马鹿、塔河马鹿、东北马鹿、甘肃马鹿、北美马鹿和高产鹿王种群的共有单倍型。其中,阿拉善马鹿、塔河马鹿、甘肃马鹿、川藏马鹿、北美马鹿和高产鹿王均具有独有单倍型。单倍型多样性介于0～0.857,核苷酸多样性介于0～0.00272,各亚种间遗传距离最大的是塔河马鹿与西藏马鹿（0.002406）,最小的是阿拉善马鹿与青海马鹿（0.000124）。基于邻接法和最大似然法构建的系统进化树一致,显示11个野生马鹿种群间共存在3个分支,支系S1包含全部马鹿种群,塔河马鹿、甘肃马鹿、北美马鹿和高产鹿王构成支系S2,北美马鹿构成支系S3,单倍型最小网络图与系统进化树一致。表明各马鹿种群之间的遗传多样性存在差异,塔河马鹿、高产鹿王和甘肃马鹿分别存在2个父系类型,北美马鹿存在3个父系类型,其他马鹿种群只存在1个父系类型,Hap-1在单倍型组S1中处于核心位置,其他单倍型分散分布于其周围,推测Hap-1为马鹿种群中较为原始的单倍型。

分类号： S825.2

  • 相关文献

[1]利用Y染色体AMELY基因分析中国马鹿的遗传多样性. 苏莹,邢秀梅,邵元臣,王洪亮,张然然,鞠贵春. 2016

[2]利用Y染色体SRY基因对马鹿的遗传多样性进行研究. 苏莹,邵元臣,张然然,周盼伊,邢秀梅. 2015

[3]渤海黑牛Y染色体遗传多样性及父系起源研究. 常振华,侯佳雯,宋恩亮,成海建,陈宏,雷初朝. 2018

[4]皖南牛Y-STRs与Y-SNPs遗传多样性研究. 侯佳雯,夏小婷,贾玉堂,刘善斋,党瑞华,陈宏,雷初朝. 2018

[5]牛、羊和鹿科动物遗传多样性及起源研究进展. 杨苏坤,陈旭,唐丽昕,董世武,王洪亮,邢秀梅. 2024

[6]西藏牛和日喀则驼峰牛Y-SNPs遗传多样性及父系起源研究. 顿珠加才,张俸伟,夏小婷,宋恩亮,陈宏,雷初朝. 2017

[7]大别山牛Y-SNPs和Y-STRs遗传多样性及父系起源研究. 李芳玉,夏小婷,贾玉堂,党瑞华,陈宏,雷初朝. 2018

[8]基于SRY基因分析梅花鹿的遗传多样性及父系类型. 董依萌,刘华淼,玉手英利,刘汇涛,鞠妍,邢秀梅,何金明,鞠贵春. 2019

[9]马鹿的起源进化与遗传多样性研究进展. 房瑞新,田雪琪,邹晨,董依萌,刘欣,邢秀梅. 2021

[10]马鹿线粒体DNA序列多态性分析. 邢秀梅,杨福合,苏伟林,李一清. 2006

[11]中国马鹿线粒体DNA多态性分析. 邢秀梅,杨福合,张兆刚,苏伟林,李一清. 2010

[12]绵羊Y染色体基因鉴定及其与父系起源的研究进展. 谢云龙,秦芳,李万宏,李发弟,乐祥鹏. 2017

[13]湘西黄牛Y-SNPs遗传多样性研究. 蔡翠翠,宁庆庆,陈秋明,祝远魁,陈宁博,陈宏,雷初朝. 2019

[14]线粒体DNA和Y染色体主要基因的研究进展. 董依萌,王天骄,刘华淼,鞠妍,刘汇涛,房瑞新,鞠贵春,邢秀梅. 2020

[15]牛、羊、马及鹿科动物母系起源和父系起源研究进展. 周永娜,刘华淼,鞠妍,张然然,王磊,董世武,邢秀梅,刘艳环. 2017

[16]牛SRY蛋白表达纯化与体外功能鉴定. 裴杰,杜卫华,刘小林,柳向军,朱化彬,赵金红,林秀坤. 2006

[17]牛早期胚胎性别鉴定PCR反应体系的优化研究. 陈从英,黄路生,陈静波,任军,肖海霞. 2003

[18](鱼央)属4种鱼SRY、SOX和HOX基因同源序列的PCR扩增分析. 付元帅,龙华,陈建武,张燕,汪登强. 2007

[19]牦牛SRY基因克隆与分子特征. 裴杰,阎萍,程胜利,褚敏,冯瑞林,梁春年,郭宪,曾玉峰,包鹏甲,朱新书. 2009

[20]奥利亚罗非鱼和尼罗罗非鱼SRY基因同源克隆和序列分析. 杨弘,夏德全,许广平,何杰,曹丽萍,吴婷婷. 2005

作者其他论文 更多>>

微信小程序