猪circME1的鉴定及其在脂肪沉积中的生物学功能预测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王畅

作者： 王畅;王冰洁;张开源;常乐彬;韩雪蕾;李新建;李秀领;余彤;乔瑞敏;原黎伟;张永前;杨峰;柏峻;王腾飞

作者机构：

关键词： 猪;circME1;亚细胞定位;脂肪沉积;ceRNA网络

期刊名称： 黑龙江畜牧兽医

ISSN： 1004-7034

年卷期： 2025 年 010 期

页码： 7-14

收录情况： 北大核心

摘要： 为了研究猪背最长肌中circME1的分子特征,并预测其在脂肪沉积调控网络中的功能机制,基于前期研究中确山黑猪和大白猪背最长肌的RNA测序数据,试验选定测序数据中差异表达的circME1作为研究对象,采用PCR扩增、Sanger测序和RNase R消化等方法对circME1的环状结构进行鉴定,采用核质分离和实时荧光定量PCR分析其生物学特性,利用miRanda和TargetScan预测miRNA结合位点,基于GO功能和KEGG通路富集分析结果构建circME1-miRNA-mRNA调控网络.结果表明:猪circME1是由ME1基因上第5个与第7个外显子构成的环状结构,具有较强的RNase R酶抗性,主要分布在细胞质中.circME1包含6个开放阅读框(ORF)、2个内部核糖体进入位点(IRES)和1个m6A甲基化修饰位点,circME1通过海绵吸附miR-455-3p、miR-6782-3p和miR-769-5p调控MAPK和PI3K-AKT信号轴.GO功能和KEGG通路富集分析结果显示,circME1的靶基因主要富集在膜结合的细胞器等相关条目及MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路和肌动蛋白细胞骨架的调控通路等.circME1在背部脂肪中的相对表达量明显高于背最长肌组织,其中确山黑猪背最长肌和背部脂肪中circME1相对表达量显著或极显著高于大白猪(P<0.05或P

分类号： S828

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