香蕉束顶病毒海口分离物基因组的克隆及序列分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 冯团诚
作者: 冯团诚;王健华;刘志昕
作者机构:
关键词: 香蕉束顶病毒;基因克隆;序列分析
期刊名称: 植物病理学报
ISSN: 0412-0914
年卷期: 2010 年 40 卷 01 期
页码: 40-50
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 以海口香蕉束顶病株的幼嫩假茎和叶片总DNA为模板,通过反向PCR法克隆了香蕉束顶病毒(Banana bunchy top virus,BBTV)海口分离物(命名为BBTV-HaiKou)的6个DNA组分的全长序列。结果表明,DNA1~6序列全长分别为1106、1040、1058、1040、1013和1082nt。各组分非编码区各包含一个茎环共同区和一个主要共同区,同源性分别为91.55%和88.45%。各组分编码区均编码一个开放可读框(ORF),其中DNA1 ORF内部还有一个小的ORF。序列分析表明,BBTV-HaiKou分离物与其它分离物间的DNA1最为保守,DNA2变异最大。DNA1组分核苷酸序列与亚洲组、南太平洋组各分离物及ABTV(Abacá bunchy top virus)分离物同源性分别为93.1%~99.1%,89.6%~90.7%和76.2%~77.4%,相应的编码蛋白氨基酸序列同源性在BBTV和ABTV中分别为93.4%~100%和85.7%。根据Karan等的分类方法,确定BBTV-HaiKou分离物属于亚洲组成员。
分类号: S436.68
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