黄秋葵实时荧光定量PCR内参基因的克隆与筛选评价

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李永平

作者： 李永平;叶新如;王彬;陈敏氡;刘建汀;朱海生;温庆放

作者机构：

关键词： 黄秋葵;内参基因;胁迫;不同组织

期刊名称： 核农学报

ISSN：

年卷期： 2021 年 001 期

页码：

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为筛选黄秋葵实时荧光定量PCR的稳定内参基因,本研究以绿白1号为试验材料,根据黄秋葵RNA-seq数据库,筛选并验证获得18SrRNA、ACT、EF-1α、TUA、TUB、GAPDH等6个内参基因ORF序列;以黄秋葵不同组织、不同发育时期果实、不同发育时期叶片和低温、高温、干旱胁迫处理的叶片为材料,利用实时荧光定量PCR技术分析测定基因表达量,并结合GeNorm、NormFinder和BestKeeper软件评价6个内参基因的稳定性.结果表明,6个基因在不同组织、各发育阶段及不同胁迫下均有表达,但表达稳定性不尽相同,其中,EF-1α在黄秋葵果荚发育、高温胁迫下表达稳定性最好;18SrRNA在黄秋葵各组织、叶发育和干旱胁迫下表达稳定性最优;ACT在低温胁迫下表现最稳定.此外,在29个处理中,18SrRNA、EF-1α、ACT表达均较稳定,可以用于荧光定量表达分析.本研究结果为黄秋葵基因功能分析和调控机理研究提供了基础.

分类号： S649

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