鹅MLPH基因分子克隆、组织表达及SNP检测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘杰

作者： 刘杰;刘毅;王翠;杨云周;王惠影;刘安芳;何大乾

作者机构：

关键词： MLPH基因;克隆;组织表达;多态性;鹅

期刊名称： 中国家禽

ISSN： 1004-6364

年卷期： 2016 年 38 卷 12 期

页码： 4-9

收录情况： 北大核心

摘要： 研究采用RT-PCR和克隆的方法获得鹅黑素亲和素(MLPH)基因的cDNA和基因组DNA序列,采用半定量RT-PCR的方法检测MLPH基因在鹅组织中的表达,并利用DNA池的方法扫描MLPH基因的多态位点。结果显示:鹅MLPH基因cDNA长2 147 bp(GenBank登录号:KU904428),包括17 bp的5′非翻译区、1 992 bp的开放阅读框和138 bp的3′非翻译区。生物信息学分析表明,鹅MLPH基因开放阅读框编码663个氨基酸残基,其分子量为74.62 ku,理论等电点为5.94。推导的MLPH氨基酸序列具有4个卷曲螺旋结构、1个锌指结构域和1个RAB结合域。鹅MLPH基因组DNA长20 540 bp(GenBank登录号:KU904431),按照"GT-AG"剪接法则,划分为16个外显子和15个内含子。进化树结果分析表明,鹅MLPH与家禽有密切的亲缘关系,特别是与绿头鸭的亲缘关系密切。半定量RT-PCR结果表明,鹅MLPH mRNA在不同的色素沉着组织中表达,如眼睛、背部皮肤、腹部皮肤和脚蹼,而在其他组织中未检测到表达。同时,鹅MLPH基因在外显子11上存在2个碱基突变(c.1506C>T、c.1542A>G),且分别导致编码的氨基酸改变(p.497Pro>Ser、p.509Lys>Glu)。该研究结果为鹅MLPH基因的研究奠定基础,为鹅羽毛颜色形成的研究提供参考。

分类号： S835.2

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