獐茅耐盐基因SOS1的克隆及序列分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 王鹤
作者: 王鹤;张高华;王旭达;丰明;李怀梅;李树英
作者机构:
关键词: 獐茅;耐盐基因;质膜Na+/H+逆向转运蛋白基因(SOS1);cDNA克隆;序列分析
期刊名称: 中国农业大学学报
ISSN: 1007-4333
年卷期: 2012 年 17 卷 03 期
页码: 28-33
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 采用RT-PCR和RLM-RACE方法从单子叶盐生植物獐茅(Aeluropus littoralis(Gouan)Parl)中克隆了质膜Na+/H+逆向转运蛋白基因(AlSOS1,JN936862),并对其基因序列进行了分析。Southern杂交试验显示:AlSOS1基因在獐茅基因组中以单拷贝形式存在。AlSOS1基因cDNA全长3 641bp,其中编码区3 420bp,编码一个1 139氨基酸的蛋白。AlSOS1编码蛋白与芦苇、水稻质膜Na+/H+逆向转运蛋白亲缘关系最为接近,达到82%和77%,与双子叶植物拟南芥的亲缘关系仅为58%;系统发育分析显示AlSOS1基因编码蛋白与其他植物质膜型Na+/H+逆向转运蛋白属于同一分支,而与液泡型Na+/H+逆向转运蛋白属于不同的分支;疏水性分析显示AlSOS1基因编码蛋白N-末端具有12个跨膜结构域,C-末端具有一个很长且面向质膜内腔的亲水尾部。这是獐茅SOS1基因编码区首次被完整克隆,将进一步应用于单子叶农作物耐盐性状改良的基因工程之中。
分类号: S184
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