烟草花叶病毒山西番茄分离物的全基因组序列测定及分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 庞小静

作者： 赵慧琪;王德富;刘勇;牛颜冰

作者机构：

关键词： 番茄;病原鉴定;烟草花叶病毒;序列分析

期刊名称： 中国蔬菜

ISSN： 1000-6346

年卷期： 2017 年 1 卷 06 期

页码： 50-55

收录情况： 北大核心

摘要： 为明确山西省晋中市侵染番茄的病毒种类,采用双链RNA(double-stranded RNA,ds RNA)技术和非序列依赖PCR扩增(sequence-independent amplification,SIA)方法对感病番茄进行分子鉴定。序列测定及分析发现,具有花叶、卷曲症状的番茄为烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)所侵染。进一步克隆TMV番茄分离物(TMV-SXFQ)的全基因组序列,得到TMV-SXFQ(Gen Bank登录号为JX993906)全长为6 394 bp,含4个开放阅读框(open reading frame,ORF)。序列比对分析表明,TMV-SXFQ与烟草花叶病毒属其他分离物的同源性为86.3%~99.6%;系统进化分析表明,TMV-SXFQ与韩国分离物IM聚为一簇、亲缘关系最近。

分类号： S436.412

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