反刍动物瘤胃噬菌体的宏基因组学研究方法及进展

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴祎程

作者： 吴祎程;冉涛;周传社;谭支良

作者机构：

关键词： 瘤胃;病毒;噬菌体;宏基因组;高通量测序

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2022 年 01 期

页码： 20-31

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 病毒(virus)存在于各种动物胃肠道中,反刍动物瘤胃也不例外。瘤胃是一个复杂且多样的微生态系统,包括细菌、真菌、原虫、古生菌和病毒等多种微生物。目前,多组学技术和生物信息学分析手段被广泛用于瘤胃细菌群落的研究。有研究表明,饲粮、环境及宿主基因型会对瘤胃细菌多样性和菌群结构产生影响;瘤胃细菌也会反过来影响宿主机体代谢、生长发育和健康状况。与瘤胃细菌相比,瘤胃病毒受到的关注相对较少。随着分子生物学技术的发展,高通量测序技术为病毒组学的研究提供了必要的支持。研究者们将宏基因组学运用于瘤胃病毒,在瘤胃液中发现了许多新型病毒,极大地丰富了人们对瘤胃病毒多样性的认知。本文从瘤胃噬菌体概念出发,重点阐述了瘤胃病毒DNA提取、测序及生物信息学分析手段,并结合其他环境病毒的研究方法进行探讨,最后对瘤胃病毒宏基因组研究的应用前景进行了总结。

分类号： S852.3

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