用磁珠富集法分离亚麻基因组微卫星分子标记

文献类型: 中文期刊

第一作者: 邓欣

作者: 邓欣;陈信波;龙松华;王孝纯;高原;何东锋;王进;王玉富

作者机构:

关键词: 亚麻;微卫星;磁珠富集

期刊名称: 作物学报

ISSN: 0496-3490

年卷期: 2008 年 34 卷 12 期

页码: 2099-2105

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 应用Dynal磁珠-生物素标记的微卫星探针(CT)15与亚麻基因组DNA酶切片段杂交,捕获300~1500bp含有微卫星序列的DNA片段,连接到pMD18-T载体中,构建富集微卫星序列的小片段插入文库。利用接头引物和根据微卫星核心序列设计的引物VRV(CT)15使用PCR方法直接对文库筛选,从422个转化子中获得了104个阳性克隆,对其进行测序分析,获得了97个微卫星序列,微卫星序列的富集效率达到22.99%,PCR扩增筛选效率93.27%。对97个微卫星序列进行比对分析,其中51个重复序列的两端序列高度相似,据其设计的特异引物对阳性克隆进行2次筛选,能淘汰相似度高的同类序列,提高筛选亚麻微卫星标记的效率。

分类号: S563.2

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