八仙花'Bailmer'全长转录组数据分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 祁惠

作者： 祁惠;张盖天;杨锁宁;褚志云;刘春;袁素霞

作者机构：

关键词： 八仙花;全长转录组;转录本;功能注释;转录因子;SSRs

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2025 年 23 卷 018 期

页码： 6010-6016

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 八仙花被广泛应用在鲜切花、盆栽、庭院种植和园林绿化中，具有较好的观赏价值，其花色形成及耐铝机理一直是被关注的热点。本研究借助PacBio SequelTM测序平台，对八仙花‘Bailmer’的根、茎、叶、侧芽、顶芽、花梗、花器官的组织混合样品进行全长转录组测序，共获得72 848条isoforms，利用NR、Swiss-Prot、KOG和KEGG蛋白数据库进行BLAST比对，其中67 941条转录本被注释。TF分析共获得3 004个预测的转录因子，隶属于55个转录因子家族。通过结构分析在34 748个isoforms中共鉴定到63 263个SSRs位点。实验结果为八仙花‘Bailmer’的二代转录组测序数据拼接提供参考模板，为后续的花色调控和耐铝机制等方面的分子机理研究提供科学依据。

分类号： S685.99

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