烟草疫霉侵染前后剑麻叶片转录组学研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 汪平

作者： 高建明;杨峰;郑金龙;刘巧莲;陈河龙;易克贤

作者机构：

关键词： 烟草疫霉;侵染;剑麻;转录组

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2014 年 35 卷 03 期

页码： 163-169

收录情况： CSCD

摘要： 为克隆剑麻受斑马纹病病原菌烟草疫霉侵染后的应答基因,以病原菌侵染前后的剑麻H.11648叶片为材料,构建剑麻转录组Unigene数据库;组装得到非冗余Unigene 131 422个,其中,500~1 000 bp的Unigene占总数65.39%,Unigene的数量随其长度递减。GO分类分析发现:在得到的所有Unigene中,注释到生物过程的基因最多(152 835);细胞组分其次(129 197);参与分子功能的最少(47 420)。KEGG代谢通路分析将剑麻转录组unigene分成128类,其中,参与生化代谢通路的Unigene最多,有9 354个,占总数27.09%;参与植物-病原互作代谢通路的基因有1 795个,占总数5.2%。基因表达丰度RPKM值显示上调基因9 415个,下调基因28 980个,其中参与病原互作的基因占680个。

分类号： S563.8

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