新疆7个小麦种5S rDNA及其NTS序列分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 米日古丽·马木提
作者: 米日古丽·马木提;玉山江·麦麦提;托乎提·艾买提;李继洋;何丹
作者机构:
关键词: 新疆小麦;5S rDNA;NTS;亲缘关系;序列分析
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2014 年 12 卷 05 期
页码: 47-56
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 本研究参照GeneBank中禾本科植物大麦5S rDNA序列,利用PCR技术扩增获得新疆7个小麦种5S rDNA部分序列,进一步与禾本科植物大麦5S rRNA序列比对,得到了5S rDNA结构和NTS边界范围。序列分析发现,不同类型小麦5S rDNA序列保守程度不同,其中大片段保守性较高,小片段相对较低,7个小麦种5S rDNA序列均存在不同程度的插入和缺失序列,同种不同类型和不同种5S rDNA非转录间隔区(NTS)长度和存在位置均呈现不同程度差异。利用MEGA4.0软件,采用邻接法(NJ)和最大简约法(MP)构建分子进化树并计算种间遗传距离。以7个小麦种进化关系的分析结果为依据,利用5S rDNA两种类型片段建立了两种不同的亲缘关系分类依据,旨在为新疆7个小麦种亲缘关系分析提供一定理论依据,以期为后期种间同源关系分析,建立序列集合,推导系统进化与发育关系,重建发育史和遗传育种奠定一定理论依据。
分类号: S512.1
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