重病田和无病田棉花根组织中细菌群落结构的差异

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘政

作者： 刘政;李燕;孙艳;张学坤;陈兵;王琦

作者机构：

关键词： 棉花黄萎病;内生细菌;变性梯度凝胶电泳;群落结构

期刊名称： 棉花学报

ISSN： 1002-7807

年卷期： 2016 年 28 卷 02 期

页码： 170-178

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究黄萎病菌侵染条件下内生细菌群落结构多样性变化,以不同时期健康棉株和感染黄萎病菌(Verticillium dahliae)的棉株根部组织为材料,提取样品总DNA,扩增内生细菌16S r DNA的V3可变区,将扩增产物进行变性梯度凝胶电泳分析,并对21个优势条带进行切胶回收、克隆测序,构建系统发育树。结果表明:不同时期发病棉株和健康棉株样品可以聚成2大类,一是苗期和蕾期的根部样品,二是初花期和结铃期的根部样品;感染黄萎病棉株内生细菌种类多样性下降;BLAST比对结果发现21个克隆序列与Gen Bank数据库中已知16S r DNA基因序列同源性很高(99%~100%),绝大多数属于变形菌门(Proteobacteria),占总克隆序列的80.95%,其他不可培养细菌占19.05%。说明黄萎病菌的侵染能明显影响内生细菌群落结构多样性。

分类号： S435.62

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