小花碱茅HKT2;1基因全长cDNA的克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李剑

作者： 李剑;张金林;王锁民;郭强

作者机构：

关键词： 小花碱茅;PutHKT2;1基因;克隆;生物信息学分析;耐盐性

期刊名称： 草业学报

ISSN： 1004-5759

年卷期： 2013 年 22 卷 02 期

页码： 140-149

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： Na+是盐渍化土壤中主要的毒害离子,对植物生长发育和农业生产构成严重威胁。高亲和性K+转运蛋白HKT2;1在控制高等植物Na+吸收,增强K+的选择性,进而提高耐盐性方面发挥着重要作用。本研究以拒盐型牧草小花碱茅为材料,采用RT-PCR和RACE(rapid amplification of cDNA ends)方法克隆到HKT2;1基因,并命名为PutHKT2;1。该基因全长1 919bp,包含1个长1 638bp的开放阅读框(ORF),编码546个氨基酸,推测分子量为60.5kDa,等电点PI为9.07。与其他植物HKT2;1氨基酸序列同源性多在66%以上,核苷酸序列同源性都在75%以上。PutHKT2;1可能跨膜11次,二级结构分析表明,PutHKT2;1蛋白含有47.99%α-螺旋、5.13%β-转角、31.87%无规则卷曲和15.01%延伸链。PutHKT2;1基因全长cDNA的克隆及其生物信息学分析为进一步揭示小花碱茅拒盐的分子机制奠定了基础。

分类号： S156.4`S184

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