枇杷WRKY转录因子鉴定与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李晓颖

作者： 李晓颖;徐红霞;陈俊伟

作者机构：

关键词： 枇杷;WRKY转录因子;特征分析;系统进化;组织表达

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2019 年 005 期

页码：

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以枇杷(Eriobotrya japonica)转录组数据为材料,利用生物信息学手段对枇杷WRKY转录因子进行鉴定与特征分析.分离鉴定出33条具典型WRKY结构域的序列,CDS长度分布在492~2 040bp,命名为EjWRKY01~EjWRKY33.分组鉴定和进化树分析结果显示,枇杷WRKY转录因子可分为3大类,其中Ⅰ类数量为6个,Ⅱ类和Ⅲ类的数量分别为22和5个,其中Ⅱ类又进一步分为a~e等5个亚类.WRKY结构域分析显示,WRKY结构域高度保守,绝大多数都含有WRKYGQK七肽和锌指结构.枇杷WRKY转录因子基因组DNA全长895~3 873 bp,编码的蛋白在163~679个氨基酸范围内,具有1~5个内含子.WRKY启动子顺式作用元件预测结果表明,大部分WRKY启动子序列具有典型的TATA和CAAT元件.将获得的所有WRKY基因与已报道的拟南芥WRKY进行进化比对分析发现,所有EjWRKY转录因子并没有位于独立的分支上,表明枇杷的基因序列虽与拟南芥物种有差别,但枇杷WRKY蛋白在调控植物生物和非生物逆境反应、信号传导、生长发育等方面的功能相似.此外,荧光定量PCR结果显示,大部分EjWRKY均在枇杷的根、茎、叶、花和果实中表达,但相对表达水平不同,说明WRKY家族基因在枇杷的生长发育中可能具有不同的功能.

分类号： S667.3

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