印度南瓜GAox家族基因鉴定及其在不同蔓长种质中的表达
文献类型: 中文期刊
第一作者: 孙廷珍
作者: 孙廷珍;疏琴;马玮;史玉滋;张蒙;向成钢;薄凯亮;段颖;王长林
作者机构:
关键词: 印度南瓜;赤霉素氧化酶;基因家族;基因进化;主蔓长度;表达分析
期刊名称: 园艺学报
ISSN: 0513-353X
年卷期: 2025 年 52 卷 003 期
页码: 603-622
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 赤霉素氧化酶家族GA2ox、GA3ox和GA20ox是植物激素赤霉素合成代谢途径后期关键酶,具有调控植株茎秆伸长等重要作用。以印度南瓜(Cucurbita maxima)参考基因组数据为基础,对其赤霉素氧化酶(GAox)家族基因进行鉴定,对其理化性质、基因结构、染色体定位、系统发育及其近缘物种基因组间的共线性关系等进行了系统分析,并在不同蔓长的印度南瓜种质中研究了其组织特异性表达模式。共鉴定到印度南瓜基因组中13个GA2ox,9个GA3ox和12个GA20ox基因。系统发育研究表明CmaGAox聚类为4个主要分支,上游启动子区分布有多个光响应、逆境胁迫、激素响应以及生长发育调控元件。CmaGAox在印度南瓜中存在9对串联复制基因和10对大片段复制基因,其中只有1对基因(CmaGA3ox5和CmaGA3ox6)受正向选择(Ka/Ks> 1)。共线性分析显示印度南瓜CmaGAox与美洲南瓜(Cucurbita pepo)和中国南瓜(Cucurbita moschata)分别存在47和48对共线性基因对。CmaGAox在果实中特异性表达较强,但CmaGA2ox1和CmaGA2ox4在主茎中表达量较高,并且在短蔓印度南瓜Cma0806中的表达量显著高于长蔓印度南瓜Cma0807,表明二者在主蔓生长调控中可能具有重要作用。
分类号: S642.1
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