榴莲蜜实时荧光定量PCR内参基因的克隆与筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郭清云

作者： 郭清云;胡福初;吴凤芝;王祥和;范鸿雁;冯学杰;陈哲

作者机构：

关键词： 榴莲蜜;内参基因;实时荧光定量PCR;不同组织;RefFinder软件

期刊名称： 中国南方果树

ISSN： 1007-1431

年卷期： 2022 年 005 期

页码： 42-49,54

收录情况： 北大核心

摘要： 为筛选榴莲蜜实时荧光定量PCR的稳定内参基因，进一步提高榴莲蜜基因表达的稳定性和准确性，根据测序获得的榴莲蜜转录组数据，筛选出10个候选内参基因；以“多异1号”榴莲蜜花序、茎、嫩叶及不同发育时期果苞为材料，通过基因克隆、实时荧光定量PCR分析，并结合4种统计分析软件评价内参基因稳定性。结果表明，克隆获得了5个榴莲蜜内参基因，分别为Actin1、α-TUB1、β-TUB1、β-TUB2和GAPDH1;这5个内参基因的转录水平在榴莲蜜不同组织及果苞发育过程中存在差异。在榴莲蜜花序、茎和嫩叶中表达稳定性最好的是β-TUB2和α-TUB1,在榴莲蜜果苞发育阶段中表达水平最稳定的是β-TUB1和α-TUB1。通过2个成花相关基因和4个蔗糖合成酶基因的表达模式验证了α-TUB1、α-TUB1+β-TUB1及α-TUB1+β-TUB2作为内参基因的可靠性。

分类号： S667.9

  • 相关文献

[1]西红花实时荧光定量PCR内参基因筛选. 周琳,蔡友铭,杨柳燕,赵冰雪,李芳,张永春. 2020

[2]黄秋葵实时荧光定量PCR内参基因的克隆与筛选评价. 李永平,叶新如,王彬,陈敏氡,刘建汀,朱海生,温庆放. 2021

[3]绵羊H-FABP基因不同组织表达差异研究. 赵雪,曹阳,周国利,金海国,赵玉民. 2014

[4]民猪外周血单核细胞实时荧光定量PCR内参基因的筛选. 马红,刘宇,汪亮,王文涛,吴赛辉,何鑫淼,刘娣. 2017

[5]大白菜-结球甘蓝易位系实时荧光定量PCR内参基因的筛选. 崔菲菲,孟川,王彦华,赵建军,陈雪平,申书兴,顾爱侠. 2018

[6]稻粒黑粉病菌实时荧光定量PCR内参基因筛选. 盘林秀,王娜,王爱军,夏园,付成林,殷得所,郑爱萍. 2018

[7]银杏实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择与验证. 苏西娅,石元豹,杨晓明,汪贵斌,曹福亮. 2019

[8]龙眼果实发育实时荧光定量PCR内参基因的筛选. 王淳璐,王彬,寇译丹,胡文舜,陈秀萍. 2021

[9]杜鹃红山茶实时定量PCR内参基因筛选及验证. 刘小飞,于波,黄丽丽,孙映波. 2020

[10]不同光质条件下刺葡萄红色愈伤组织的RT-qPCR内参基因筛选. 潘红,赖呈纯,张静,黄贤贵,林玉玲,赖钟雄. 2019

[11]栽培远志qRT-PCR内参基因筛选与P450s基因的时空表达分析. 李娟,孔冉冉,梅月菊,张福生,田洪岭,秦雪梅,杜晨晖,马存根. 2019

[12]萱草不同器官实时荧光定量PCR内参基因的筛选. 梁锦,刘海婷,钟荣,李昊,尹冬梅,刘翔,秦巧平,张志国,段可,倪迪安. 2020

[13]澳洲坚果实时荧光定量PCR分析中内参基因的筛选. 杨倩,杨子平,周娅丽,陈东泉,刘恒. 2020

[14]近零磁场下粘虫雌蛾内参基因转录表达稳定性评价. 闫蒙蒙,张蕾,程云霞,江幸福. 2021

[15]柠檬色百合实时荧光定量PCR内参基因筛选. 梁蕤,徐雷锋,毕蒙蒙,王静,唐玉超,郝泽慧,刘一洁,杨盼盼,明军,杜方. 2023

[16]杂交兰实时荧光定量PCR内参基因的筛选. 林榕燕,钟淮钦,黄敏玲,樊荣辉,吴建设. 2018

[17]钝裂银莲花花色素合成相关基因qRT-PCR内参基因的筛选. 马璐琳,段青,崔光芬,杜文文,贾文杰,王祥宁,王继华,陈发棣. 2021

[18]秋石斛RT-qPCR内参基因的筛选与验证. 侯天泽,易双双,张志群,王健,李崇晖. 2022

[19]橡胶草实时荧光定量PCR内参基因评价. 覃碧,潘敏,余海洋,杨玉双,甘霖. 2016

[20]镰刀菌酸胁迫下节瓜实时荧光定量PCR分析内参基因的选择. 张金平,何晓明,江彪,谢大森,彭庆务,王永飞,马三梅. 2014

作者其他论文 更多>>

微信小程序