高粱SBP基因家族鉴定及干旱胁迫下的表达模式分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 姜昱雯

作者： 姜昱雯;陈满静;赵应;任艳;周棱波;沈佳奇;邵明波

作者机构：

关键词： 高粱;SBP基因家族;生物信息学分析;基因表达;干旱胁迫

期刊名称： 山东农业科学

ISSN： 1001-4942

年卷期： 2024 年 56 卷 003 期

页码： 1-10

收录情况： 北大核心

摘要： 在高等植物中,SQUAMOSA Promoter Binding Protein-Box(SBP)普遍参与植物的生长、开花调控及细胞程序性死亡等过程.本研究对高粱(Sorghum bicolor L.)SBP转录因子家族进行鉴定并进行生物信息学分析,同时利用qRT-PCR对高粱SBP基因在PEG-6000 模拟干旱胁迫下的表达进行分析,以验证其功能.结果表明,从高粱中共鉴定出 19 个SBP成员,除第 8 条染色体外,其他 9 条染色体上均分布有SBP基因;绝大部分SBP蛋白在亚细胞水平定位于细胞核,且均为亲水性蛋白质.系统发育分析结果表明,与水稻类似,这 19 个高粱SBP基因也可分为 3 个亚类,分别含有 7、5、7 个SBP基因;相比于拟南芥,高粱SBP与水稻、玉米的SBP关系更近.启动子顺式作用元件预测结果显示,高粱SBP可能参与了脱落酸、茉莉酸甲酯信号通路,部分成员可能与植物的低温响应、昼夜节律调控有关.qRT-PCR分析结果显示,高粱SBP基因的表达具有组织特异性,有 17 个基因受干旱胁迫诱导上调表达,且随胁迫时间的延长存在差异化表达模式.本研究结果可为后续研究高粱SBP基因的功能提供理论依据.

分类号： S514%Q78

  • 相关文献

[1]糜子SBP基因家族鉴定及在籽粒稃壳色形成中的表达分析. 郝子义,刘天鹏,何继红,董孔军,任瑞玉,张磊,韦恒,李亚伟,杨天育. 2025

[2]玉米转录因子ZmSPL16的克隆与功能鉴定. 崔扬,冯彦辉,陈众峰,王晓敏,王云鹏,杜贤章. 2019

[3]谷子Aux/IAA家族基因干旱胁迫响应表达模式分析. 刘晶,王俊杰,程璐,陈利青,禾璐,候蕊,韩渊怀. 2017

[4]玉米ZmWRKY36基因的生物信息学及功能分析. 王文丽,穆春华,张发军,刘霞,冷冰莹,姚国旗,闫振伟,刘巍,王昀,张恩盈. 2023

[5]蒙古冰草脱水素基因生物信息学识别及表达分析. 翟永青,马艳红,范菠菠,房永雨,张学峰,于卓,李坤,吴婧,闫秀秀,赵彦. 2024

[6]工业大麻ZF-HD转录因子的鉴定及表达分析. 翟莹,高双,王志刚,赵明,祁宏英,马天意,张军,李珊珊. 2024

[7]西葫芦NCED基因家族鉴定及其响应干旱胁迫分析. 刘建汀,叶新如,张前荣,李永平,温庆放,朱海生. 2023

[8]干旱胁迫下大蒜叶绿素合成基因家族鉴定分析. 王紫彤,周倩怡,田洁. 2022

[9]大葱AfUFGT2基因的克隆及干旱胁迫下的表达分析. 张宇辰,徐欢欢,王永勤. 2022

[10]基于转录组的大蒜水通道蛋白基因家族的鉴定与分析. 张国莉,周倩怡,余小奎,赵胤泽,张祥林,田洁. 2024

[11]高粱转录因子基因SbSBP15的克隆及表达分析. 方远鹏,蒋君梅,杜巧丽,陈美晴,裴会敏,屈志广,任明见,谢鑫. 2020

[12]高粱GAox基因家族的鉴定及其在种子萌发中的表达分析. 姜昱雯,任艳,陈满静,赵强,张国兵,沈佳奇,高旭,邵明波. 2025

[13]灰毡毛忍冬MADS-box基因家族AGL15基因的克隆、生物信息学和表达分析. 蔡嘉洛,朱贻霖,陈林,樊悦,刘峰,张亚丽,欧阳琳,刘湘丹. 2016

[14]糜子抗白粉病基因(Mlo)编码蛋白的序列特征及表达分析. 石甜甜,何杰丽,秦明月,陈凌,王海岗,王瑞云,乔治军. 2018

[15]小麦细胞分裂素受体基因TaHK1的生物信息学及表达特性分析. 孙丽静,赵慧,吕亮杰,张颖君,胡梦芸,刘茜,李辉. 2019

[16]玉米蔗糖转运蛋白基因ZmSUT4克隆及其低温胁迫下的表达模式. 弓雪,姜敏,齐欣,刘欣芳,卢生乔,陈坤,刘亚利,张述宽,马涛,杨耀迥. 2019

[17]‘富士’苹果Ca~(2+)/H~+反向转运蛋白基因生物信息学及表达模式分析. 程玉豆,冯云霄,关军锋. 2015

[18]荔枝漆酶(LAC)基因家族鉴定及表达分析. 李郑华,姜成东,王鹏,李芳,王树军,刘耀婷,李焕苓,王果,王家保. 2023

[19]小麦TaMICU1-6A基因的克隆、生物信息学及表达分析. 李欣,李鲁华,任明见,安畅,洪鼎立,赵鹏鹏,徐如宏. 2024

[20]绵羊MYL基因家族的鉴定与组织表达分析. 杨杨,余乾,刘昱成,杨华,赵卓,王立民,周平,杨庆勇,代蓉. 2024

作者其他论文 更多>>

微信小程序