高粱SBP基因家族鉴定及干旱胁迫下的表达模式分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 姜昱雯

作者： 姜昱雯;陈满静;赵应;任艳;周棱波;沈佳奇;邵明波

作者机构：

关键词： 高粱;SBP基因家族;生物信息学分析;基因表达;干旱胁迫

期刊名称： 山东农业科学

ISSN： 1001-4942

年卷期： 2024 年 56 卷 003 期

页码： 1-10

收录情况： 北大核心

摘要： 在高等植物中,SQUAMOSA Promoter Binding Protein-Box(SBP)普遍参与植物的生长、开花调控及细胞程序性死亡等过程.本研究对高粱(Sorghum bicolor L.)SBP转录因子家族进行鉴定并进行生物信息学分析,同时利用qRT-PCR对高粱SBP基因在PEG-6000 模拟干旱胁迫下的表达进行分析,以验证其功能.结果表明,从高粱中共鉴定出 19 个SBP成员,除第 8 条染色体外,其他 9 条染色体上均分布有SBP基因;绝大部分SBP蛋白在亚细胞水平定位于细胞核,且均为亲水性蛋白质.系统发育分析结果表明,与水稻类似,这 19 个高粱SBP基因也可分为 3 个亚类,分别含有 7、5、7 个SBP基因;相比于拟南芥,高粱SBP与水稻、玉米的SBP关系更近.启动子顺式作用元件预测结果显示,高粱SBP可能参与了脱落酸、茉莉酸甲酯信号通路,部分成员可能与植物的低温响应、昼夜节律调控有关.qRT-PCR分析结果显示,高粱SBP基因的表达具有组织特异性,有 17 个基因受干旱胁迫诱导上调表达,且随胁迫时间的延长存在差异化表达模式.本研究结果可为后续研究高粱SBP基因的功能提供理论依据.

分类号： S514%Q78

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