番茄黄化曲叶病毒北京分离物的全基因组序列测定及进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 芦佳

作者： 芦佳;刘健;王慧;肖雅文;李常保

作者机构：

关键词： 番茄黄化曲叶病毒;分子检测;序列分析;进化

期刊名称： 内蒙古大学学报(自然科学版)

ISSN： 1000-1638

年卷期： 2014 年 03 期

页码： 273-280

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 番茄黄化曲叶病(tomato yellow leaf curl disease,TYLCD)在我国危害日益严重.为了对该病进行深入有效的了解,根据已知的番茄黄化曲叶病毒(tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)基因组DNA-A序列的保守区段,设计两对背向引物;针对北京地区的3个TYLCV分离物进行分子鉴定.结果显示该分离物为单组分病毒,不含DNA-B和卫星DNA-β,是TYLCV的2个新分离物.TYLCV-BJ1与BJ2基因组全长分别为2781bp和2779bp,同源性为99.8%,都编码6个开放阅读框.对TYLCV的分子进化分析表明,国内现已发现的TYLCV株系亲缘关系都很接近,同源性在97.1~99.9%,属于以色列TYLCV-IL株系进化下的一个近代分支.从全基因组和各基因的逐个比对结果看,TYLCV的AV1和AV2保守性最高,其次是AC2和AC3.当TYLCV-Mld进化成TYLCV-IL时,AC1和AV4基因发生了较大的变化,IR区的同源性更是从小于70%上升到94.3%.国内的TYLCV株系分成2个亚群,但在地理分布上没有形成严格的区域限定,北京分离物属于CN I亚群.

分类号： S436.412.11

  • 相关文献

[1]邯郸、保定番茄黄化曲叶病毒检测及其DNA-A全序列分析. 李志勇,谢夏青,李兴红,董志平. 2011

[2]番茄黄化曲叶病毒的快速分子检测. 李常保,崔彦玲,张丽英,李传友. 2012

[3]我国不同地区番茄主要病毒病种类的分子检测与分析. 陈利达,石延霞,谢学文,曹金强,柴阿丽,李宝聚. 2020

[4]江苏省番茄黄化曲叶病毒和褪绿病毒复合侵染的分子检测. 李廷芳,赵文浩,程兆榜,郭青云,赵统敏,余文贵,朱叶芹,季英华. 2016

[5]天津地区番茄褪绿病毒的分子检测和鉴定. 高利利,孙国珍,王勇,高苇,张春祥,张安胜,竺晓平. 2015

[6]天津地区番茄黄化曲叶病毒DNA-A的克隆和序列分析. 金凤媚,薛俊,郏艳红,周祥明,王建江,刘仲齐. 2011

[7]ToCV和TYLCV复合侵染番茄后部分病毒基因序列分析及实时荧光定量PCR分析. 宋建,薛俊,金凤媚,孙海波,张越,王姝,范寰,周祥明,陈锐. 2019

[8]广东省番茄黄化曲叶病毒的分子鉴定及序列分析. 汤亚飞,佘小漫,李正刚,于琳,蓝国兵,邓铭光,何自福. 2019

[9]番茄黄化曲叶病毒侵染危害海南番茄及其分子特征. 汤亚飞,周洋,张丽,李正刚,佘小漫,于琳,蓝国兵,邓铭光,何自福. 2020

[10]河北省石家庄市番茄黄化曲叶病毒及其伴随DNAβ的分子鉴定及序列分析. 韩旭良,康忱,田哲娟,王鹏,李亚栋,赵雪芳,闫洪波,刘美霞,吴志明. 2023

[11]番茄黄化曲叶病毒山东泰安分离物的全基因组克隆与分析. 刘文浩,仇平平,辛相启,苏文敏,王祥,竺晓平. 2012

[12]浙江省番茄黄化曲叶病毒的分子鉴定及序列分析. 袁伟,万红建,王荣青,叶青静,阮美颖,李志邈,周国治,姚祝平,刘云飞,杨悦俭. 2013

[13]江苏省及其他地区番茄黄化曲叶病毒的分子鉴定及序列分析. 姜静,王银磊,李亚茹,赵丽萍,周蓉,陈伟男,赵统敏,余文贵. 2018

[14]番茄黄化曲叶病毒在湖北首次报道. 汤亚飞,何自福,杜振国,佘小漫,蓝国兵,罗方芳. 2015

[15]家蚕杆状病毒半胱氨酸蛋白酶基因的序列分析及表达. 林旭瑷,张志芳,李卫国,何家禄,尚金燕. 2002

[16]绦虫半胱氨酸蛋白酶抑制剂家族成员的鉴定及结构分析. 郭爱疆,张少华,王帅,侯俊玲,李君君,魏艳玲,骆学农,才学鹏. 2015

[17]华北地区猪繁殖与呼吸综合征病毒变异分析. 焦文强,白献晓,徐引弟,王克领,郎利敏,朱文豪,李海利,张青娴,张立宪,游一,王治方,许峰. 2017

[18]河南省大蒜病毒病的分子检测. 孙新艳,史亚娟,王振跃,燕照玲,孙虎,施艳. 2016

[19]北京地区侵染菊花的番茄斑萎病毒分子检测与基因组部分序列分析. 金凤媚,宋建,薛俊,陈东亮,王姝,张越,孙海波. 2020

[20]番茄褐色皱纹果病毒分子检测与基因组部分序列分析. 华明艳,宋兰芳,崔少杰,孙海波,金凤媚. 2024

作者其他论文 更多>>

微信小程序