高温胁迫下不同玉米材料间的基因差异表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 曹丹

作者： 曹丹;张红梅;杨海鹏;赵欢;刘小红

作者机构：

关键词： 玉米;转录组;高温胁迫;差异表达

期刊名称： 甘肃农业大学学报

ISSN： 1003-4315

年卷期： 2021 年 56 卷 001 期

页码： 42-49

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]认识高温胁迫条件下不同玉米材料间的基因差异表达,为阐明玉米耐高温胁迫的分子遗传机制提供理论基础.[方法]以耐高温胁迫的中地88和高温敏感的先玉335两个玉米品种为试验材料,在42℃高温条件下取其花粉提取总RNA,再经mRNA纯化、反转录、文库构建及转录组测序等一系列过程,对其基因差异表达作生物信息学分析.[结果]共发现基因24553个,以先玉335为对照,上调表达基因857个,下调表达基因965个,无显著差异表达基因22731个,这些基因较均一地分布于玉米的10条染色体.对差异表达基因进行GO富集分析,结果显示:与细胞组分、分子功能及生物过程相关的GO条目数分别为491、1062和2320个;在GO注释的差异表达基因中,进一步分析发现直接应答于热激效应的基因有7个,其中2个上调表达,5个下调表达;与热激蛋白结合有关的基因有3个,其中1个上调表达,2个下调表达.对差异表达基因作KEGG富集分析发现有102个小通路,这些小通路可进一步归为6个大通路,包括细胞过程3个、环境信息处理4个、遗传信息处理20个、人类疾病1个、新陈代谢72个和有机系统2个.[结论]转录组测序是在基因组水平认识基因差异表达的有效方法,共发现12个与玉米耐高温胁迫相关的差异表达基因.

分类号： S513

  • 相关文献

[1]营养生长期持续高温处理对玉米叶片转录组及生化指标的影响. 陈岩,岳丽杰,刘永红,杨勤. 2022

[2]高温胁迫下陆地棉转录组差异性分析. 王辉,董永梅,郭伟锋,曹新川,郭金成,谢宗铭,何良荣. 2023

[3]基因表达系列分析技术在植物基因表达分析中的应用. 朱莉,常汝镇,邱丽娟. 2003

[4]亚洲小车蝗响应高效氯氰菊酯胁迫的转录组及抗性相关基因分析. 高海燕,杨旭兵,闫锋,孙彦楠,张玉,高书晶. 2024

[5]菠萝蜜响应低温胁迫的转录组分析. 杜英俊,朱鹏锦,钟云婕,唐秀观,何江,宋奇琦,欧景莉,叶维雁. 2023

[6]高温胁迫下棉花苗期的生理响应和转录组分析. 王晓曼,王琼珊,夏松波,王孝刚,张教海,张友昌,张兴中,别墅. 2019

[7]高温胁迫下火龙果转录组及热激蛋白响应分析. 李俊成,党芸芝,孙清明. 2024

[8]基于转录组学解析铜驯化缓解高温胁迫对大黄鱼的氧化损伤. 谢正丽,宋炜,吉群,曾霖. 2023

[9]高温胁迫下萝卜苗期的转录组分析. 周娜,郑阳,陆景伟,胡燕,陶伟林,雷开荣,潘晓雪. 2022

[10]高温胁迫下黑龙江茴鱼幼鱼肝脏组织结构变化及转录组表达特征. 丰超杰,刘霞飞,张颖,吕伟华,韩世成,张永泉,许式见,马波. 2023

[11]高温胁迫条件下大菱鲆肾脏转录组研究. 杨凯,黄智慧,马爱军,刘晓菲,杨双双. 2020

[12]外源钙离子对高温胁迫下草莓幼苗影响的转录组分析. 张圣美,裘波音,徐谦,黄宗安,罗天宽. 2024

[13]菜心叶片响应高温胁迫的转录组分析及转录因子筛选. 庞强强,孙晓东,周曼,蔡兴来,陈贻诵,王亚强. 2024

[14]水稻苗期高温RNA-SEQ分析. 张伟,张亚龙,台德卫,张效忠,汪婉琳. 2021

[15]玉米cDNA-SRAP反应体系的优化. 苏亮,白建荣,王秀红. 2010

[16]穗期高温对玉米子粒灌浆生理及产量的影响. 付景,孙宁宁,刘天学,马俊峰,杨豫龙,赵霞,穆心愿,李潮海. 2019

[17]转录组及代谢组联合解析玉米响应花粒期高温胁迫机制. 李川,乔江方,黄璐,张美微,张盼盼,牛军,刘京宝. 2020

[18]转录组及代谢组联合解析郑单309响应花粒期高温胁迫的机制. 李川,黄璐,乔江方,张美微,张盼盼,牛军,刘京宝,王淑凤. 2021

[19]玉米花期耐热性评价指标及防御技术研究. 文廷刚,杜小凤,刘京宝,杨文飞,顾大路,罗玉明,王伟中. 2021

[20]玉米叶片"源"的高温胁迫阈值研究. 张学鹏,李腾,王彪,刘晴,刘涵瑜,陶志强,隋鹏. 2021

作者其他论文 更多>>

微信小程序