雷蒙德氏棉DnaJ蛋白的生物信息学预测及盐胁迫下的表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 徐珍珍

作者： 徐珍珍;郭琪;刘静;徐鹏;张香桂;沈新莲

作者机构：

关键词： Dna J蛋白;雷蒙德氏棉;旱地棉;克劳茨基棉;生物信息学;表达模式;差异表达基因

期刊名称： 棉花学报

ISSN： 1002-7807

年卷期： 2015 年 27 卷 05 期

页码： 391-400

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： Dna J蛋白是一类很大的蛋白家族,是近年来研究较多的与胁迫反应等相关的蛋白。本文利用生物信息学手段,系统研究了雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii)Dna J蛋白的数目、分类、染色体定位、亚细胞定位、进化以及在旱地棉(Gossypium aridum)和克劳茨基棉(G.klotzschianum)盐胁迫下的表达模式。结果显示:雷蒙德氏棉基因组有119个Dna J蛋白,长度从73个氨基酸到2574个氨基酸不等;在13条染色体上不均匀分布,且具有不同的亚细胞定位;Dna J结构域大致被分为9个小组,每个小组都有与拟南芥同源的基因;盐胁迫下,鉴定到旱地棉和克劳茨基棉共同差异表达的Dna J基因3个,在旱地棉盐胁迫整个过程中差异表达的基因2个。雷蒙德氏棉Dna J基因家族的鉴定和分析,将为进一步研究Dna J基因家族的功能奠定一定的基础。

分类号： S562

  • 相关文献

[1]雷蒙德氏棉KNOX基因家族全基因组鉴定及表达分析. 孙润润,秦腾飞,王园园,刘用生,郭新磊,余春丽,王清连. 2023

[2]雷蒙德氏棉Argonaute基因家族的生物信息学预测与分析. 吴嫚,于霁雯,裴文锋,喻树迅. 2014

[3]雷蒙德氏棉和亚洲棉Alfin-like PHD finger家族的生物信息学分析. 马盼盼,赵曾强,叶春秀,孙国清,谢宗铭. 2018

[4]雷蒙德氏棉PIF-like转座元件鉴定与特征分析. 徐珍珍,彭珍,刘静,沈新莲,杜建厂. 2016

[5]棉花MAPKs 家族成员的聚类分析. 翟伟卜,张珊珊,郭安慧,张文蔚,简桂良,段江燕,齐放军. 2016

[6]棉花FAR1/FHY3基因家族的全基因组分析. 袁娜,王彤,刘廷利,杨郁文,郭月,刘静,张保龙,杜建厂. 2018

[7]雷蒙德氏棉和亚洲棉TCP 基因家族的生物信息学分析. 李燕,姚金波,陈伟,张永山. 2016

[8]棉花MAPKs家族成员的聚类分析. 翟伟卜,张珊珊,郭安慧,张文蔚,简桂良,段江燕,齐放军. 2016

[9]棉花CAD基因家族的生物信息学分析. 胡文冉,郝晓燕,赵准,邵武奎,高升旗,李建平,黄全生. 2023

[10]急性T淋巴细胞性白血病关键基因的筛选与验证. 蒋光洁,陈燕华,郭维,张航,邹琳. 2018

[11]烟草NtMLO家族全基因组序列鉴定及表达分析. 张孝廉,张吉顺,余世洲,余婧,赵德刚. 2019

[12]白刺14-3-3基因家族的鉴定及表达分析. 易丹,王博,段慧荣,李毅,王丽蓉. 2021

[13]菜豆ANK基因家族鉴定及ANK25的表达模式分析. 张婷,张双喜,裴丽丽,于太飞,陈明,李连城,周永斌,马有志,徐强. 2014

[14]玉米生长素响应因子基因家族全基因组鉴定及表达分析. 曹丽茹,张前进,郭子宁,鲁晓民,张新,魏昕,皇甫柏树,王振华. 2021

[15]可可毛色二孢全基因组分泌蛋白的预测及分析. 邢启凯,李铃仙,曹阳,张玮,彭军波,燕继晔,李兴红. 2020

[16]西方蜜蜂Sirtuin蛋白家族基因鉴定及表达分析. 宋文菲,刘娜,苗春辉,余玉生,胡宗文,王艳辉,李亚辉. 2023

[17]滇龙胆1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸合酶基因的克隆与表达分析. 张海晨,李彩霞,王元忠,张晓东. 2016

[18]茶尺蠖水通道蛋白EoAQP1的cDNA克隆、多克隆抗体制备及亚细胞定位. 李良德,王定锋,刘丰静,李慧玲,张辉,吴光远. 2016

[19]棉花抗细胞凋亡基因GhDAD1的克隆、定位及表达分析. 龚文芳,喻树迅,宋美珍,范术丽,庞朝友,肖水平. 2010

[20]亚洲棉NF-YA基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 王园园,赵春月,孙润润,秦腾飞,张金宝,郑巨云,杨秋月,翟勇全,孙家良,王清连. 2021

作者其他论文 更多>>

微信小程序