雷蒙德氏棉DnaJ蛋白的生物信息学预测及盐胁迫下的表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 徐珍珍

作者： 徐珍珍;郭琪;刘静;徐鹏;张香桂;沈新莲

作者机构：

关键词： Dna J蛋白;雷蒙德氏棉;旱地棉;克劳茨基棉;生物信息学;表达模式;差异表达基因

期刊名称： 棉花学报

ISSN： 1002-7807

年卷期： 2015 年 27 卷 05 期

页码： 391-400

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： Dna J蛋白是一类很大的蛋白家族,是近年来研究较多的与胁迫反应等相关的蛋白。本文利用生物信息学手段,系统研究了雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii)Dna J蛋白的数目、分类、染色体定位、亚细胞定位、进化以及在旱地棉(Gossypium aridum)和克劳茨基棉(G.klotzschianum)盐胁迫下的表达模式。结果显示:雷蒙德氏棉基因组有119个Dna J蛋白,长度从73个氨基酸到2574个氨基酸不等;在13条染色体上不均匀分布,且具有不同的亚细胞定位;Dna J结构域大致被分为9个小组,每个小组都有与拟南芥同源的基因;盐胁迫下,鉴定到旱地棉和克劳茨基棉共同差异表达的Dna J基因3个,在旱地棉盐胁迫整个过程中差异表达的基因2个。雷蒙德氏棉Dna J基因家族的鉴定和分析,将为进一步研究Dna J基因家族的功能奠定一定的基础。

分类号： S562

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