基于转录组测序的乌桕叶色相关基因的挖掘

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王晓晓

作者： 王晓晓;郑旭;赵文静;缪美华;刘兴满

作者机构：

关键词： 乌桕;叶色变化;转录组;基因挖掘;分子机制;呈色

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2024 年 40 卷 008 期

页码： 1521-1532

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 乌桕(Triadica sebifera)耐盐碱能力强，叶色随季节变化显著，尤以秋季观赏性最佳，是园林绿化中常用的彩叶植物。为揭示乌桕叶片呈色的分子机制，本研究对自主选育的3个乌桕品种连桕1号、云台红桕、云台金桕转色前后的叶片进行转录组测序，共获得123.78 GB测序数据，70 815个高质量单一基因序列(Unigenes),其中48 367个Unigenes得到了功能注释。将3个乌桕品种转色前后的转录组数据进行两两对比，各比较组之间鉴定出共有的差异表达基因(DEG)2 674个。GO分析发现，DEG主要与细胞过程、细胞、结合等生物学功能相关。通过KEGG Pathway功能分析，筛选出53个与乌桕叶色相关的DEG,包括与花青素合成有关的基因14个，与卟啉和叶绿素代谢有关的基因22个，与类胡萝卜素生物合成有关的基因17个。其中花青素合成途径相关基因在乌桕转色后相对表达量上升，叶绿素、类胡萝卜素合成途径相关基因相对表达量下降，而叶绿素、类胡萝卜素降解途径相关基因相对表达量上升，该结果与叶片中色素含量的变化趋势一致。本研究结果可为探究乌桕叶片呈色机制提供理论依据。

分类号： S687

  • 相关文献

[1]紫叶紫薇新品系叶色变化转录组分析. 王莹,李玉娟,李敏,马祥建,谈峰,郭聪,张健. 2018

[2]紫叶紫薇新品系叶色变化转录组分析. 王莹,李玉娟,李敏,马祥建,谈峰,郭聪,张健. 2018

[3]美国红枫叶片转录组分析. 郭聪,王莹,谈峰,陈燕,李玉娟. 2020

[4]高粱苗期耐盐性转录组分析和基因挖掘. 董明,再吐尼古丽·库尔班,吕芃,杜瑞恒,叶凯,侯升林,刘国庆. 2019

[5]玉米苗期根部比较转录组分析揭示耐盐性差异机制. 董菁,张春宵,刘学岩,金峰学,刘文平,吴委林,李晓辉. 2023

[6]基于WGCNA的刺葡萄抗白腐病关键基因的发掘. 谭西北,李鹏,孙磊,樊秀彩,刘崇怀,姜建福,张颖. 2023

[7]甘蓝型油菜抗茎倒材料的筛选与候选基因挖掘. 罗桂林,张超,杨斌,唐容,张玉玲,肖华贵. 2023

[8]转录组数据分析与功能基因挖掘. 李欣,李小俊,陈晓丽,赵毅强,王栋. 2019

[9]NaCl处理谷子萌发期种子的转录组学分析. 潘教文,李臻,王庆国,管延安,李小波,戴绍军,丁国华,刘炜. 2019

[10]紫叶紫薇新品系叶色变化理化因素研究. 王莹,李敏,谈峰,马祥建,郭聪,李玉娟. 2018

[11]洒金柏色素变化及光合作用响应特征. 廖婷,付琳,郭丽琴,刘国彬,王烨,姚砚武,曹均. 2021

[12]桂花叶色变化机理及育种研究进展. 涂勋良,蒋彧,秦帆,汪锦,万斌. 2024

[13]玫瑰茄红色素在金属盐溶液中的稳定性研究. 王丽霞,肖丽霞,吴志玲,范伶颖,陆烝. 2022

[14]葡萄间作模式对茶树新梢品质及呈色的影响. 李露露,姚键梅,尹荣秀,蒲璐璐,文洁,周富裕. 2022

[15]呈色机制不同的桃叶片花色素苷积累及合成相关基因表达的季节性差异. 王小青,韩键,文杨,姜卫兵,房经贵,张斌斌,马瑞娟. 2016

[16]玉米籽粒呈色机理初探. 冯汉宇,仇天雷,魏建华,张殿朋,陈刚. 2019

[17]夏季喷施磷酸二氢钾和蔗糖混合液对红叶桃叶片呈色的影响. 韩键,骆晓梦,张斌斌,翁忙玲,化香平,姜卫兵. 2012

[18]矮牵牛RCW基因的克隆及功能分析. 袁欣,符真珠,王利民,张晶,董晓宇,张泰然,高杰,蒋卉,王慧娟,李艳敏,张和臣. 2019

[19]~(60)Co-γ射线辐射对乌桕生物学效应研究初报. 葛金涛,王丽丽,吴秋月,赵统利,刘兴满. 2017

[20]乌桕和无患子容器苗育苗密度与苗木生长和质量的关系. 郑坚,马晓华,廖亮,陈秋夏,钱仁卷,张旭乐. 2016

作者其他论文 更多>>

微信小程序