文献类型: 中文期刊
第一作者: 王楠楠
作者: 王楠楠;姜安安;王蓓;王晓旭;毕庄莉;唐井玉;刘光清;王桂军
作者机构:
关键词: 鸭坦布苏病毒;AH-F10株;全基因组;序列分析
期刊名称: 中国兽医科学
ISSN: 1673-4696
年卷期: 2014 年 01 期
页码: 50-54
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为了解鸭坦布苏病毒安徽分离株AH-F10的分子特征,利用RT-PCR方法对其全基因组序列进行了克隆,并将全基因组及其推导的氨基酸序列与参考毒株进行序列比对及系统进化分析。结果显示,毒株AH-F10的全基因组序列长10 990nt,含有1个大的阅读框架,两侧各有一个非编码区(Untranslation region,UTR)。序列比对结果表明,AH-F10株与13株参考毒株的基因编码区具有较高的氨基酸序列同源性,其中与江苏JS2010株的同源性最高,达98%。研究还发现,鸭坦布苏病毒各分离株的5′UTR的序列表现一定程度的变异,AH-F10株与参考株的核苷酸序列同源性在94%~97%之间。此研究结果为进一步了解鸭坦布苏病毒的遗传变异及构建该病毒的反向遗传学操作系统奠定了基础。
分类号: S852.659.6
- 相关文献
[1]鸭坦布苏病毒鸭胚成纤维细胞适应病毒编码基因序列测定及分析. 李云霞,刘晓丽,张玥,韩宗玺,邵昱昊,刘胜旺,孔宪刚. 2013
[2]Ⅰ型鸭肝炎病毒A66弱毒株全基因组分子克隆及序列分析. 黄显明,张小飞,魏建忠,李春芬,廖俊伟,毛火云. 2009
[3]犬细小病毒JL-M13株分离鉴定及全基因组序列分析. 仝明薇,易立,程世鹏,孙长英,王文宪. 2014
[4]森林草莓全基因组WRKY转录因子基因的鉴定与分析. 苗立祥,张豫超,杨肖芳,蒋桂华. 2012
[5]猪传染性胃肠炎病毒分离株JS2012全基因组序列分析. 郭容利,李彬,范宝超,温立斌,茅爱华,周萍,何孔旺. 2016
[6]鸭甲肝病毒GX株全基因组序列测定及VP1蛋白生物信息学分析. 黄云秀,李传峰,孟春春,陈宗艳,李露,宋凯杰,刘光清,韦天超. 2015
[7]猪圆环病毒2型滨州分离株全基因组的克隆与序列分析. 张文通,李峰,魏凤,苗立中,吴家强,沈志强. 2015
[8]大白菜WRKY转录因子的全基因组鉴定与分析. 蒋明,苗立祥,张豫超,管铭,潘小翠. 2013
[9]1型鸭肝炎病毒E53株和HP-1株全基因组序列分析. 陈晓丹,张云,王钰,郭冬春,李永锋. 2009
[10]甜瓜全基因组WRKY转录因子基因的鉴定与分析. 苗立祥,蒋明,李建波,寿森炎. 2014
[11]鹅细小病毒弱毒株的培育及其致弱前后全基因组中核酸变异的分析. 张青山,李晨曦,刘明,邵周伍林,张云. 2016
[12]犬瘟热病毒AH株全基因组序列测定及其分子特征. 刘柱,李丹丹,李琦,宫晓华,缪秋红,李传峰,陈宗艳,张淼涛,刘光清. 2017
[13]小反刍兽疫病毒FY株全基因组序列的测定及其分子特征的研究. 刘柱,缪秋红,李琦,宫晓华,李传峰. 2017
[14]2株H9N2亚型禽流感病毒全基因组序列测定及遗传性分析. 沈佳,章振华,姜北宇,李林,景小冬,张建伟. 2011
[15]猪繁殖与呼吸综合征病毒流行株Jiangxi-3的全基因组序列分析. 王旭荣,张彩勤,赵炳武,张春红,杨增岐,宋长绪. 2009
[16]猪圆环病毒2型吉林分离株全基因组的克隆与序列分析. 杨博超,王凤雪,温永俊,李建喜,杨志强,武华. 2013
[17]2株H9N2亚型禽流感病毒全基因组序列测定及遗传性分析(英文). 沈佳,章振华,姜北宇,李林,景小冬,张建伟. 2011
[18]马铃薯帚顶病毒基因组克隆与侵染性克隆构建. 刘野,高艳玲,刘佳慧,方月,马廷帅,毛彦芝,张丽莉,白艳菊,程晓非. 2022
[19]猪源乙型脑炎病毒HEN0701株全基因组的分子特征. 郑浩,孙春清,袁世山. 2011
[20]猪圆环病毒2型山西株全基因组序列分析. 孟帆,吴忻,姚敬明,樊振华,刘文俊,王娟萍,韩一超,薛翼鹏,米瑞娟,李玉斌. 2016
作者其他论文 更多>>
-
猫传染性腹膜炎及其疫苗研究进展
作者:刘光清
关键词:猫传染性腹膜炎;冠状病毒;猫传染性腹膜炎病毒;疫苗
-
猫白血病病毒的研究进展
作者:庞帅赛;朱世强;刘光清;孟春春
关键词:猫白血病;结构;致病机理;预防
-
鸭源巴氏杆菌的分离鉴定及致病性研究
作者:刘丹;冯雅婷;陈宗超;朱敏;郭容;王桂军;于圣青
关键词:鸭源巴氏杆菌;分离;鉴定;耐药性;致病性
-
自噬在猪繁殖与呼吸综合征病毒感染中的作用机制研究进展
作者:李睿;梁跃;白杨;张桂悦;王楠楠;乔松林;张改平
关键词:猪繁殖与呼吸综合征病毒;感染;自噬;作用机制;抗病毒靶点
-
犬疱疹病毒gD蛋白单克隆抗体的制备及抗原表位鉴定
作者:李博;汤傲星;祝萌;张子晨;朱雯琪;刘光清
关键词:犬疱疹病毒;gD蛋白;单克隆抗体;抗原表位
-
猫杯状病毒NS2蛋白的截短表达及多克隆抗体的制备与应用
作者:董宁宁;张琦;谈晓梅;李娜;朱雯琪;刘光清;孟春春
关键词:猫杯状病毒;NS2蛋白截短;原核表达;多克隆抗体
-
嵌杯病毒主要衣壳蛋白的研究进展
作者:谈晓梅;徐彦召;刘光清;孟春春
关键词:嵌杯病毒;主要衣壳蛋白;结构;功能