慢性密度胁迫对绿鳍马面鲀肌肉转录组的影响

文献类型： 中文期刊

第一作者： 程起群

作者： 程起群;段晓晨;宋丹

作者机构：

关键词： 密度胁迫;基因表达;转录组;绿鳍马面鲀;养殖

期刊名称： 水产科技情报

ISSN： 1001-1994

年卷期： 2024 年 51 卷 001 期

页码： 29-37

收录情况： 北大核心

摘要： 为了解慢性密度胁迫下绿鳍马面鲀(Thamnaconus septentrionalis)肌肉组织的分子响应机制,挖掘密度胁迫下的相关信号通路和差异表达基因,设置 2 个养殖密度组(即 100 尾/m3 的中密度组和 500 尾/m3 的高密度组)对绿鳍马面鲀肌肉转录组进行了研究.分别于第 25 天和第 50 天时获得养殖绿鳍马面鲀的肌肉组织,利用Illumina测序平台对肌肉组织样本进行了转录组测序,得到 103.3 Gb高质量测序数据.对照开始时暂养的绿鳍马面鲀,各试验组均筛选出大量的差异表达基因.通过GO(Gene Ontology)功能注释与KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)功能富集分析,筛选出涉及破骨细胞分化、MAPK、PI3K-Akt等路径以及黏着斑相关的信号传导机制,发现 nfatc1、tgfbr2、map3k14、pparg、fos、flna、flnc、fn1、tln1、thbs1 等关键基因在绿鳍马面鲀肌肉组织中的差异性表达.研究表明,这些差异表达基因可能在调节绿鳍马面鲀的细胞生长和分化、免疫能力等方面发挥关键作用.

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