比较基因组学分析鱼源荧光假单胞菌的致腐和适应性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘静聪

作者： 刘静聪;冯立芳;吴诗媛;朱军莉;励建荣;李婷婷

作者机构：

关键词： 荧光假单胞菌;全基因组测序;致腐;适应性

期刊名称： 水产学报

ISSN： 1000-0615

年卷期： 2022 年 46 卷 007 期

页码： 1178-1187

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探究荧光假单胞菌的强致腐和环境适应性,实验通过分析2株海水鱼源荧光假单胞菌的蛋白酶活性和挥发性盐基氮(TVB-N)的形成,并采用比较基因组学方法解析致腐和适应机制.结果显示,荧光假单胞菌PF07和PF08在冷藏鱼汁中的蛋白酶活性强,积累较多TVB-N.经全基因组测序、组装和功能注释后,得到PF07基因组长度为6.13 Mb,GC含量61.4%.通过泛基因组分析可知,PF07与PF08核心基因共4980个,独特基因分别有516和470个.COG和KEGG注释显示2株致腐菌基因组中参与氨基酸代谢基因占比最高,PF07独特基因参与无机离子转运代谢居多.碳水化合物活性酶CAZy注释表明,2株荧光假单胞菌基因组中糖苷转移酶与糖苷水解酶基因均占比最高,还鉴定得到大量分解碳水化合物、蛋白质和脂质等多种底物的酶和相关蛋白基因,特别有碱性金属蛋白酶AprA、多胺ABC转运蛋白渗透酶PotC、精氨酸与鸟氨酸脱羧酶等多种降解蛋白酶.另外,2株致腐菌分布有rpoS、rpoN和rpoD多种σ因子.2株鱼源荧光假单胞菌表现出强的致腐性,研究通过比较基因组学方法解析荧光假单胞菌分布多种编码蛋白酶和腐胺形成的氨基酸代谢基因、分解糖原和脂肪的基因及环境适应调控因子.本研究从基因水平初步揭示了荧光假单胞菌强分解蛋白质等多种底物的分子基础,有助于深入探究该菌的代谢特征和致腐机制.

分类号： Q781%S983

  • 相关文献

[1]大黄鱼源气单胞菌的分离鉴定及致腐表型. 葛阳杨,朱军莉,刘丽,任奕婧. 2017

[2]顺反式肉桂醛对肉源隆德假单胞菌生物被膜和致腐性的抑制作用. 顾春涛,王雅莹,朱军莉,胡婧. 2020

[3]鲜枣贮藏期致腐病原菌种类研究. 夏宏,夏青,王春生,李建华,赵桂芳. 2007

[4]0℃冷藏下三文鱼片菌相变化规律及特定腐败菌的分离鉴定. 李婷婷,丁婷,邹朝阳,周凯,仪淑敏. 2015

[5]半滑舌鳎致病性荧光假单胞菌的分离鉴定及其感染的病理损伤. 高桂生,张艳英,吉志新,史秋梅,陈娟,高光平,秦凌暄,韩红升,宋青春. 2016

[6]荧光假单胞菌工程菌株的构建及对黄瓜枯萎病的防治效果. 岳东霞,张要武,陈融,许长蔼. 2008

[7]生防荧光假单胞菌2P24中EnvZ/OmpR双因子系统克隆与OmpR原核表达. 孙冰冰,张伟,段红英,李伟,田涛,张力群. 2014

[8]影响枯草芽胞杆菌和荧光假单胞菌原生质体再生的因素. 匡逢春,郑重谊,谭周进,谢达平,肖冰梅,谢丙炎. 2008

[9]绿原酸对荧光假单胞菌群体感应现象及其腐败特性的抑制作用. 王虹懿,吴海虹,张新笑,刘芳,孙芝兰,诸永志,王道营,徐为民,彭景. 2020

[10]绿原酸与Ⅲ型细菌素复配对鸡肉中假单胞菌的抑菌机制. 王虹懿,唐敏敏,吴海虹,诸永志,刘芳,孙芝兰,徐为民,彭景. 2020

[11]荧光93菌体和代谢物对全蚀病菌和小麦生长影响的初步研究. 彭于发,黄大昉,陈彩层,张杰. 1992

[12]荧光假单胞菌D93菌株在小麦根上的扩散. 王道本,彭于发. 1995

[13]鱼源荧光假单胞菌生物被膜形成和致腐表型的研究. 严羽萍,刘丽,朱军莉,陆海霞,励建荣. 2019

[14]rpoS基因缺失突变对荧光假单胞菌胁迫耐受性、群体感应及腐败活性的影响. 沈碧妙,吴淘栩,朱俊杰,徐琳娜,刘小香,朱军莉. 2018

[15]基于亚甲基蓝的水体急性毒性快速检测方法研究. 吴立冬,刘玲,李丹,付啸辰,刘欢,宋怿,马兵,翟俊峰. 2016

[16]氯化钙对食品致腐荧光假单胞菌生物被膜形成的影响. 樊洁敏,唐蓉,王雅莹,朱军莉,陆海霞. 2019

[17]不同二氧化碳比例气调对冷鲜鸡肉中荧光假单胞菌的抑制作用. 张新笑,章彬,卞欢,王道营,吴满刚,孙芝兰,诸永志,徐为民. 2018

[18]荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens)MF11对根结线虫病的防效评价. 周冬梅,何亮亮,李伟山,冯辉,赵敏,纠敏,魏利辉. 2021

[19]荧光假单胞菌CZ对TMV的抑制作用及其活性蛋白的分离纯化. 申莉莉,王凤龙,董小卫,钱玉梅,杨金广,孙慧丽. 2011

[20]双价杀虫蛋白基因在荧光假单胞菌中的表达及增效. 张杰,宋福平,黄大昉,李季伦. 2000

作者其他论文 更多>>

微信小程序