基于WGCNA挖掘天津猴鸡裸颈性状相关基因

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴鹏飞

作者： 吴鹏飞;夏树立;于海涛;赵向华;王康

作者机构：

关键词： 天津猴鸡;裸颈性状;加权基因共表达网络分析(WGCNA)

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2024 年 005 期

页码： 881-889

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 天津猴鸡是中国珍贵的裸颈鸡遗传资源，为在全基因组范围内探究其裸颈发育相关基因，本研究采集天津猴鸡杂交F1代裸颈鸡和常羽鸡颈部皮肤组织用于转录组测序。加权基因共表达网络分析（WGCNA）结果显示，识别到的10个基因模块中只有蓝绿色（turquoise）和蓝色（blue）基因模块与裸颈表型显著相关，共计583个基因；GO功能富集分析富集到脂滴组织、甘油三酯储存负调控以及肌肉收缩等脂肪和肌肉相关生物学过程等条目；KEGG通路分析也富集到多条脂肪代谢相关通路，包括PPAR信号通路和甘油酯代谢等；蛋白质互作网络分析结果显示ACTN2基因编码的蛋白质的连通性最高，其次是MYL10基因编码的蛋白质，另外，还发现多个密切参与毛囊发育的基因，包括SOX9和PPARGC等。本研究结果将为进一步揭示并完善鸡裸颈的形成和发育奠定基础，同时对天津猴鸡的保护、开发和利用具有重要意义。

分类号： S831.2

  • 相关文献

[1]基于简化基因组测序的天津猴鸡遗传进化研究. 夏树立,周成浩,赵向华,于海涛,张会永,殷建玫,薛倩,韩威,李国辉. 2022

[2]荷斯坦牛肌肉组织中与妊娠末期、泌乳期及繁殖力相关的基因共表达网络构建. 唐雪颖,张志飞,童雄,陈卫东,闵力,巨向红,李大刚. 2024

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