芝麻坏死花叶病毒（SNMV）部分cDNA合成及序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 晏立英

作者： 晏立英;陈坤荣;韩成贵;张宗义;于嘉林;许泽永

作者机构： 中国农业科学院油料作物研究所;中国农业大学

关键词： cDNA合成;芝麻;坏死花叶病毒;序列分析;外壳蛋白原因;同源性

期刊名称： 中国油料作物学报

ISSN： 1007-9084

年卷期： 2002 年 24 卷 2 期

页码： 61-66

收录情况： CSCD

摘要： 提取芝麻坏死花叶病毒RNA，反转录合成cDNA，对滞后重组质粒进行点杂交，得到阳性克隆并且测定序列。经计算机分析，获得3368个核苷酸（nt)的序列。该序列含有一个完整的开放阅读框架（ORF),该ORF由1134nt组成，推测编码377个氨基酸，分子量为40．047×10^3道尔顿（Da)。经比较它与Tombusviride科中Avreusvirus属石柑子潜隐病毒（Pothos laten virus,PoLV)，Tombusvirus属病毒Cymbidium ringspot virus(CRSV)外壳蛋白（CP)氨基酸序列同源性分别为40．7％，40．1％，其起始氨基酸Tombusvirus ,Aureusvirus属另外的病毒CP起始氮基酸具有很高的保守性。根据这个完整ORF所编码蛋白的大小，与CRSV，PoLV病毒CP具一定的同源性，CP5’端氨基酸的保守性，推测这个完整的ORF可能包含该病毒的外壳蛋白基因，并且这个病毒可能类似PoLV病毒，是Tombusviride科Aureusvirus属的一种新病毒。

分类号：

  • 相关文献

[1]鹅副粘病毒YG_(97)分离株HN蛋白基因的克隆与序列分析. 刘华雷,王永坤,朱国强,严维巍. 2002

[2]节瓜Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列的克隆及比对. 赵芹,谢大森,江彪,罗少波,彭庆务,李明珠. 2014

[3]11株禽多杀性巴氏杆菌OmpA基因克隆测序及其序列分析. 高明燕,徐步,龚建森,王鑫,范建华,刘学贤. 2013

[4]猪瘟野毒E2基因同源性比较. 郭慧琛,邱昌庆,周继章,孙世琪,高双娣,程淑敏. 2003

[5]绵羊外源性JSRV-LTR克隆与序列分析. 罗军荣,周艳喜,武志红,高华,周建华,马学恩. 2009

[6]斜纹夜蛾核型多角体病毒不同分离株基因序列的同源性分析. 刘艳荷,方继朝. 2008

[7]芝麻坏死花叶病毒(SNMV)部分cDNA合成及序列分析. 晏立英,陈坤荣 ,韩成贵,张宗义,于嘉林,许泽永. 2002

[8]猪繁殖与呼吸综合征病毒GS株结构蛋白基因的克隆及结构特征分析. 马友记,柳纪省,张利. 2010

[9]犬瘟热疫苗株CDV_3核蛋白基因全序列测序及分析. 王凤雪,闫喜军,柴秀丽,张海玲,邵西群,罗国良,赵建军. 2007

[10]猪水泡病病毒结构蛋白编码区核苷酸的序列测定与分析. 冶贵生,刘湘涛,张彦明,马玉花,张淼涛,韩雪清,张永国. 2004

[11]8株禽多杀性巴氏杆菌外膜蛋白H基因序列分析. 高明燕,徐步,龚建森,王鑫,俞燕,范建华,刘学贤. 2013

[12]香蕉枯萎病菌线粒体小亚基(mtSSU)rDNA的克隆及序列分析. 郑荔,兰成忠,姚锦爱,阮宏椿,陈福如. 2012

[13]猪水泡病病毒非结构蛋白编码区的克隆与序列分析. 冶贵生,刘湘涛,张彦明,马玉花,邓明俊,洪海霞,韩雪清. 2004

[14]禽多杀性巴氏杆菌C48-1株omp基因克隆及序列分析. 陈红梅,施少华,程龙飞,傅光华,彭春香,黄瑜. 2008

[15]猪捷申病毒中国株3ABC基因的克隆及序列分析. 李娟,刘磊,冯力. 2007

[16]猪带绦虫45W基因家族的克隆及A_3与B_2的表达和结构预测. 郑亚东,贾万忠,骆学农,景志忠,才学鹏. 2004

[17]黄瓜花叶病毒甜瓜分离物外壳蛋白基因的克隆及序列分析. 古勤生,马新艳,刘丽锋,李宁,杨民和,彭斌,李莉. 2004

[18]枣树类病毒的检测及鉴定. 刘光要,刘春芹,吴祖建,姜冬梅,李世访. 2009

[19]减蛋综合征病毒NE4株全基因组序列测定与分析. 董春娜,李刚,邱文英,张坤,哈小琴. 2010

[20]芝麻八氢番茄红素脱氢酶基因SiPDS的克隆与序列分析. 于沐,文艺,赵辉,苗红梅,刘红彦. 2015

作者其他论文 更多>>

微信小程序