瘤胃细菌群落多样性研究中DGGE方法的优化

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张俊

作者： 张俊;赵圣国;王加启;卜登攀;金迪;杜洪

作者机构：

关键词： 瘤胃;细菌群落;DGGE;单链DNA

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN：

年卷期： 2015 年

页码： 10

收录情况： CSCD

摘要： 为了提高瘤胃细菌多样性研究中变性梯度凝胶(denaturinggradientgelelectrophoresis,DGGE)方法的准确性，本研究对DGGE的最佳变性剂梯度范围、PCR扩增程序和PCR产物处理方法进行了优化。设计DGGE变性剂浓度梯度为35%~70%、40%~60%和55%~65%3个梯度，分别利用一步PCR和修补PCR(reconditioningPCR)对瘤胃细菌16SrDNA进行扩增；PCR产物分别经变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(d-PAGE)和绿豆核酸酶纯化；之后对DGGE凝胶图谱聚类分析，并选取部分DGGE条带割胶测序。结果表明，DGGE的变性剂浓度为...

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