药用植物苦参SSR-PCR体系的优化与验证

文献类型： 中文期刊

第一作者： 段永红

作者： 段永红;渠云芳;王长彪;毕红园;王玉庆;孙毅;杨武德

作者机构：

关键词： 苦参;SSR;优化;正交设计

期刊名称： 中国农业大学学报

ISSN： 1007-4333

年卷期： 2014 年 19 卷 05 期

页码： 101-106

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为有效利用SSR-PCR技术对药用植物苦参进行遗传多样性分析,采用正交设计L16(45)对影响苦参SSRPCR体系的5个因素(Taq酶、Mg2+、模板DNA、dNTP、引物)在4个水平上进行优化,PCR结果用DPS数据处理软件分析,筛选出各因素的最佳水平,建立适宜苦参SSR-PCR的反应体系和扩增程序,并选用内蒙古苦参对该体系进行稳定性验证。结果表明:在10μL的苦参SSR-PCR体系中,模板DNA的用量为20.0ng,Taq DNA聚合酶的用量为0.2~0.6U,Mg2+的浓度为2.5mmol/L,dNTPs浓度为0.1mmol/L,引物的浓度为0.6μmol/L。扩增程序为:94℃预变性3min;94℃变性1min,56℃退火45s,72℃1min,35个循环;72℃延伸10min。4℃保存。选用12份苦参DNA对该体系进行稳定性验证,该体系具有较高的扩增稳定性,可用于药用植物苦参SSR标记的研究。

分类号： S567.53

  • 相关文献

[1]胡麻专化型尖孢镰刀菌ISSR-PCR最佳反应体系的建立. 苑琳,刘姗姗,路福平,李子钦,张辉. 2011

[2]应用正交设计对大白菜纯度鉴定中EST-SSR反应体系的优化. 赵新,贺长征,兰青阔,陈锐,齐志伟,李欧静,朱珠,王永,郭永泽. 2013

[3]冬枣SRAP扩增体系的优化. 杨丽丽,吴明朝,巩檑,石磊,甘晓燕,宋玉霞. 2013

[4]青枯病和根肿病生防细菌BS2004的发酵培养基和培养条件优化. 周青,王笑,苏婷,路梅,谢关林. 2012

[5]暗纹东方鲀SRAP-PCR体系的建立与优化. 程长洪,张敏莹,刘凯,徐东坡,段金荣,周彦锋,施炜纲. 2011

[6]黄皮SRAP反应体系优化正交实验研究. 杨向晖,黄建峰,傅嘉欣,谢江辉. 2009

[7]基于DSSAT模型和正交试验相结合的春小麦灌溉模式优化研究. 魏玉清,沈强云,郝正刚. 2019

[8]电磁内热式绿茶毛火工艺参数优化与分析. 袁海波,滑金杰,王近近,李佳,江用文,邓余良,王岳梁. 2018

[9]小桐子基因组DNA的提取及ISSR-PCR反应体系的优化. 欧文军,李开绵,王文泉. 2008

[10]利用正交设计优化番茄SRAP-PCR反应体系. 郭彩杰,侯丽霞,崔娜,韩明利. 2011

[11]利用正交设计优化烟草SRAP反应体系. 陈万胜,王元英,罗成刚,杨爱国,蒋彩虹,范静苑. 2008

[12]利用正交设计优化向日葵ISSR-PCR反应体系. 梁春波. 2014

[13]正交设计优化扁蓿豆ISSR反应体系的研究(英文). 李志勇,李鸿雁,孙启忠,王小丽,师文贵,邢建军. 2010

[14]利用正交设计优化亚麻SRAP-PCR反应体系. 吴建忠. 2012

[15]茶树TRAP反应体系的建立及正交设计优化. 张丽群,成浩,王丽鸳,韦康. 2012

[16]SRAP在西藏木瓜属种质资源研究中的应用. 夏永秀,曾秀丽,廖明安,潘光堂,龚君华,次仁卓嘎. 2010

[17]割手密AFLP分子标记技术体系建立与优化. 段维兴,刘新龙,杨海霞,高轶静,罗霆,宋焕忠,张革民. 2013

[18]利用正交设计优化一品红SRAP反应体系. 姜维华,陶俊,冯立国,苏家乐. 2009

[19]茶树TRAP反应体系的建立及正交设计优化. 张丽群,成浩,王丽鸳,韦康. 2012

[20]利用正交设计优化甘蔗SRAP-PCR反应体系. 昝逢刚,刘家勇,赵俊,赵培方,吴转娣,吴才文. 2011

作者其他论文 更多>>

微信小程序