野生稻Wx基因(CT)n卫星序列和第一内含子SNP特征标签初探

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王炎炎

作者： 王炎炎;孙一丁;马继琼;杨奕;许明辉

作者机构：

关键词： 野生稻;Wx基因;SNP

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2016 年 35 卷 12 期

页码： 3458-3464

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究利用特异引物对来源于云南的22份栽培稻及分别来源于海南、云南元江、江西东乡的3份普通野生稻(O.rufipogon Griff.)和1份长雄野生稻(O.longistaminata)Wx基因中第1内含子和第1内含子上游微卫星序列(CT)n的序列进行PCR扩增并测序。结果显示所有材料均能扩增出产物并获得碱基测序(包括长雄野生稻),4份野生稻的(CT)重复次数分别是(CT)8、(CT)10、(CT)10、(CT)11,较栽培稻少;第1内含子中+1位碱基均为G。相较于栽培稻,野生稻在第1内含子与(CT)n重复中有明显区别于栽培稻的SNP位点,包含基因突变的In Del、转换和颠换3种类型。说明野生稻和栽培稻在进化的过程中出现了差异。Wx基因中微卫星序列(CT)n和第1内含子的序列可作为检测野生稻遗传组分的一个遗传标签。

分类号： S511.9`Q943.2

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