番茄CCCH类锌指蛋白家族的鉴定及其表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李贤国

作者： 李贤国;戴麒;王泽鹏;陈兆龙;闫会转;李宁

作者机构：

关键词： CCCH;番茄;生物信息学;表达分析

期刊名称： 中国农业科技导报(中英文)

ISSN： 1008-0864

年卷期： 2025 年 27 卷 001 期

页码： 80-95

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： CCCH（C3H）型锌指蛋白是进化上保守的RNA结合蛋白质，主要与DNA和RNA结合来调控基因表达，不仅参与植物的生长发育和激素调控过程，同时也响应生物和非生物胁迫。运用生物信息学方法，在番茄（Solanum Lycopersicum）中鉴定出47个SlC3H基因，不均匀地分布在12条染色体上，主要定位于细胞核中。根据系统进化树将其分为3个亚族（Ⅰ～Ⅲ）。共线性分析发现，SlC3H基因家族存在基因复制现象，表明在进化过程中SlC3H基因可能通过复制进行家族成员扩增。番茄SlC3H基因含有1～14个外显子，其启动子区域存在与激素和非生物胁迫响应的元件。Ka/Ks分析表明，SlC3H基因家族成员和C3H基因在进化过程中经历了强烈的进化选择。qRT-PCR分析发现，在盐胁迫下，SlC3H基因家族有一半以上的基因表达上调，其中SlC3H1在8 h时表达量最高，是0 h的30倍；用0.1 mol·L-1 2,4-表油菜素内酯（2,4-epibrassinolide,EBR）处理后所有SlC3H基因在绿熟期都表达上调，表达量是对照组的8～150倍，尤其是SlC3H28在其他时期表达量几乎为0，但在绿熟期其表达量是对照组的150倍，推测EBR对果实绿熟期的发育有促进作用。上述研究结果为进一步揭示番茄C3H基因家族在响应非生物胁迫以及果实发育中的功能提供了参考依据。

分类号： S641.2

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