不同熔解曲线分析技术在犬细小病毒基因分型中的比较
文献类型: 中文期刊
第一作者: 嘎利兵嘎
作者: 嘎利兵嘎;锡林塔娜;刘志成
作者机构:
关键词: HRM-PCR;FMCA-PCR;CPV-2;基因分型;熔解温度
期刊名称: 中国兽医杂志
ISSN: 0529-6005
年卷期: 2021 年 009 期
页码: 32-37,42
收录情况: 北大核心
摘要: 本试验旨在建立基于聚合酶链式反应(PCR)技术的犬细小病毒2型(CPV-2)2种不同熔解曲线技术基因分型方法,并通过比较其熔解温度差异(△Tm)评价不同方法对犬细小病毒单核苷酸多态性(SNP)位点的分型鉴别能力。结果显示,探针熔解曲线聚合酶链式反应(FMCA-PCR)方法中不同SNP位点之间熔解温度差异(△Tm)均大于3℃,而在高分辨率熔解曲线聚合酶链式反应(HRM-PCR)方法中熔解温度差异(△Tm)只有0.2~0.6℃。临床30份CPV-2核酸样本基因分型结果显示,FMCA-PCR方法的准确率为100%;而HRM-PCR方法准确率为96.6%(未形成杂合子前)。虽然HRM-PCR方法中不同SNP位点之间熔解温度差异较小,影响其基因分型结果,但通过杂合子HRM分析后可提高该方法的准确率。本试验结果表明,基于PCR方法的2种不同熔解曲线基因分型技术均具有较好的SNP位点分型鉴别能力,为熔解曲线基因分型技术在兽医临床中的应用提供实际参考依据。
分类号: S852.65
- 相关文献
[1]温州市瓯海地区汉坦病毒的分子流行病学调查. 段正秀,谭有将,熊海萍,陈化新,张永振,郑金海. 2009
[2]高分辨熔解曲线基因分型技术及其在水稻分子育种中的应用. 顾建强. 2019
[3]毛细管电泳在基因分型中的应用. Asad Rehman,李玉秋,赵洪锟,夏正俊,王玉民,袁翠平,刘晓冬,齐广勋,王英男,王超越,董英山. 2018
[4]基因分型技术在单核细胞增生性李斯特菌监测溯源上的应用. 蒋兵,谢建华,汪子淳,梁望旺,杨泽林,蔺露,张婷娟,彭远义,聂奎,方仁东. 2018
[5]石河子地区绵羊细粒棘球绦虫分离株的基因型研究. 王志胜,陈桂香,张艳艳,王正荣. 2017
[6]番茄5个抗病基因KASP分型技术体系的建立与应用. 王鹏,田哲娟,康忱,李亚栋,王洪乐,杨超沙,邙光伟,康亮,范庆杰,吴志明. 2021
[7]马铃薯高支链淀粉突变体‘P24023’的HRM分子标记开发与应用. 范书华,董清山,赵团结,解国庆,王艳,赵云彤,时新瑞. 2019
[8]鸭疫里默氏杆菌ERIC-PCR基因分型. 彭凌,杨旭夫. 2018
[9]33个杨柳品种指纹图谱构建. 何旭东,郑纪伟,孙冲,何开跃,王保松. 2021
[10]大口黑鲈“优鲈1号”生长相关优势基因型的分析. 徐磊,白俊杰,李胜杰,樊佳佳. 2014
[11]应用荧光标记通用引物检测鲤鱼(Cyprinus Carpio)微卫星基因型. 常玉梅,高国强,韩启霞,池炳杰,梁利群. 2010
[12]生长相关优势基因型在大口黑鲈‘优鲈1号’选育世代中的聚合. 徐磊,白俊杰,李胜杰,孙成飞. 2014
[13]水稻单核苷酸多态性及其应用. 刘传光,张桂权. 2006
[14]两种SNP分型方法的比较及其在柚品种鉴定中的应用. 杨润婷,吴波,李翀,曾培,曾继吾,钟云,姜波,周碧容,钟广炎. 2013
[15]利用HRM功能标记检测黑龙江省水稻种质资源抗稻瘟病基因Pi2的基因型分布. 郭震华. 2022
[16]广东地区副猪嗜血杆菌KRG血清分型及基因分型多态性分析. 贾爱卿,李春玲,王贵平,杨冬霞,何丽丽. 2010
[17]通过精液移植构建中国明对虾家系及微卫星分型鉴定父本. 罗坤,高焕,于飞,张天时,张庆文,孔杰. 2010
[18]副猪嗜血杆菌分离株耐药性、血清型及RAPD基因型分析. 吴村,崔国林,金文杰,张鑫宇,路明华,陈小玲,王宏俊,朱瑞良,徐福洲. 2015
[19]利用HRM功能标记检测黑龙江省水稻抗稻瘟病基因Pita和pik的基因型分布. 郭震华,黄翠红,罗文龙,黄晓群,王瑞英,陈志强,关世武,张淑华,蔡丽君. 2021
[20]中国鼠疫现况与基因分型. 张涛,冯志勇,杨林,姚丹丹. 2010
作者其他论文 更多>>
-
广东某猪场母猪流产的病原检测和分析
作者:聂晶晶;陈家璐;陈家玥;徐绍栋;瞿云芝;刘志成;张建峰;张春红
关键词:猪圆环病毒2型;河流漫游球菌;药敏试验
-
干扰素刺激基因20的研究进展
作者:沈海燕;王梦璐;王松祺;聂晶晶;瞿云芝;刘志成;张春红;廖明;张建峰
关键词:干扰素刺激基因20;核酸外切酶;抗病毒机制;生物标志物
-
猪ISG20基因生物信息学分析及其抗PEDV感染的初步研究
作者:王梦璐;张志杰;李之晗;聂晶晶;瞿云芝;张春红;刘志成;沈海燕;张建峰;孙亚妮;李玉谷
关键词:干扰素刺激基因20;生物信息学分析;真核表达;猪流行性腹泻病毒
-
猪流行性腹泻病毒在稳定表达猪ACE2基因的IPEC-J2细胞中的增殖研究
作者:沈海燕;康桦华;刘志成;张建峰;张春红
关键词:猪小肠上皮细胞;血管紧张素转换酶2;猪流行性腹泻病毒;增殖
-
猪繁殖与呼吸综合征病毒血清抗体监测及其变化规律分析
作者:康桦华;马祥;刘志成;张建峰;徐志宏
关键词:猪繁殖与呼吸综合征病毒;抗体监测;基准线范围;S/P值;离散度
-
泌乳奶牛采食、反刍、逍遥行为和日粮纤维性物质表观消化率对比分析
作者:朱大鹏;刘超;胡臻北;林蔓菁;吴复渠;周庆祥;刘志成;张微;杨红建;莫放
关键词:奶牛;泌乳阶段;采食行为;反刍行为;逍遥行为;表观消化率
-
泌乳盛期和泌乳后期奶牛的采食行为和日粮营养物质表观消化率的对比分析
作者:朱大鹏;刘超;胡臻北;林蔓菁;吴复渠;周庆祥;刘志成;杨红建;张微;莫放
关键词:泌乳阶段;采食行为;消化率;奶牛