基于SSR分子标记的核桃涩味遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘警

作者： 刘警;李扬;刘金利;张馨方;白仲奎;于秋香

作者机构：

关键词： 核桃;SSR;涩味;遗传多样性;毛细管电泳

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2024 年 39 卷 0S1 期

页码： 23-30

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为研究核桃种质资源涩味的遗传多样性，以4个不同核桃涩味群体共118份种质资源为材料，利用SSR毛细管电泳荧光标记技术进行遗传多样性研究，并构建树状聚类图。结果表明：12对引物共检测到93个等位变异位点，变异范围为2～18,平均每对SSR引物可检测到7.75个等位位点；多态性信息量(PIC)为0.357 9～0.785 2,平均0.541 1。4个群体的多态位点数Np为91、多态位点百分率PPB为97.85%、观测等位基因数Na为1.978 5、有效等位基因数Ne为1.198 5、Shannon′s信息指数I为0.209 7、Nei′s多样性指数H为0.126 3、总遗传多样性指数Ht为0.126 7、群体内遗传多样性指数Hs为0.122 2,说明4个核桃群体的遗传多样性和变异度不高。群体间遗传分化系数Gst为0.035 5,说明群体内遗传变异占总变异的96.45%。其中稍涩群体多态性位点百分率最大，为72.04%,说明稍涩群体在4个群体中遗传多样性最丰富。UPGMA聚类分析表明，4个群体的遗传相似系数为0.989 8～0.997 1,群体的整体相似系数高，说明这4个群体的遗传距离很近。当相似系数为0.993 4时，可将4个群体分成2组。其中，第1组包括不涩、稍涩和较涩3个群体，剩余涩群体单独为一组。通过计算不同群体93个位点的基因频率，发现12对引物的41个位点可将不同涩味等级的资源区分开。利用SSR分子标记技术对4个核桃群体进行与涩味相关的遗传多样性分析，根据转录组测序结果筛选出12对引物用于SSR分析，共扩增出93个SSR位点，多态位点百分率为97.85%,说明引物的多态性高，适用于核桃的遗传多样性分析，为培育轻涩味的优良品种提供技术指导，可用于后续核桃涩味的遗传多样性及育种研究。

分类号： S664.1

  • 相关文献

[1]基于SSR荧光标记的广西天冬种质资源遗传多样性分析. 郑德波,石前,蒙平,庾韦花. 2023

[2]基于单宁含量的核桃涩味评价体系初建. 刘警,李扬,刘金利,王英杰,于秋香. 2023

[3]利用SSR技术对部分核桃品种(系)亲缘关系分析研究. 杨丽芳,王芝学,梁海永. 2013

[4]基于SSR标记的中亚生态区核桃(Juglans regia L.)遗传多样性与种群结构分析. 马凯,赵钰,张恒,韩立群,赵国庆,王继勋. 2021

[5]普通核桃(Juglans regia)3个群体遗传结构的SSR分析. 刘晓丽,陈学森,张美勇,陈晓流,何天明,张立杰,张春雨. 2008

[6]明清板栗古树指纹图谱的构建. 刘国彬,曹均,兰彦平,王金宝. 2017

[7]基于雌雄花序表达谱测序的板栗SSR标记开发及其应用. 邱文明,徐育海,何秀娟,仝铸,肖翠,张娜,孙中海. 2020

[8]利用SSR标记进行枣树子代苗父本鉴定. 王斯琪,唐诗哲,孔德仓,贺润平,刘华波,麻丽颖,刘君,王哲,李颖岳,申连英,庞晓明. 2012

[9]玉米SSR引物尾巴序列的设计方法. 匡猛,王凤格,赵久然,邢国风,易红梅,孙艳美,于新艳,王璐. 2007

[10]毛细管电泳荧光检测中的异常电泳类型及原因分析. 王凤格,易红梅,赵久然,王璐. 2007

[11]适用于玉米特定分离群体的高通量SSR检测技术研究. 邹丽梅,王凤格,赵久然,许理文,易红梅,宋伟. 2011

[12]玉米品种SSR标记毛细管电泳荧光检测法与变性PAGE银染检测法的比较研究. 易红梅,王凤格,赵久然,王璐,郭景伦,原亚萍. 2006

[13]利用荧光标记SSR构建火龙果种质资源分子身份证. 武志江,邓海燕,梁桂东,陆贵锋,黄凤珠,刘朝安,李祯英,黄黎芳. 2020

[14]基于SSR标记的12个非洲菊品种指纹图谱构建及杂交F1后代鉴定. 刘小飞,于波,任桂萍,余超然,刘冲,孙映波,钟荣辉,冯恩友. 2023

[15]玉米通用SSR核心引物筛选及高通量多重PCR复合扩增体系建立. 王凤格,赵久然,戴景瑞,易红梅,匡猛,孙艳美,于新艳,郭景伦,王璐. 2006

[16]73份紫心甘薯品种SSR标记指纹图谱构建. 高闰飞,苏在兴,后猛,唐维,刘旋旋,闫会,王欣,刘亚菊,张允刚,马代夫,李强. 2019

[17]烟草SSR荧光标记与毛细管电泳检测技术研究. 陈雅琼,李凤霞,李锡坤,徐军,张磊,王绍美,孙玉合. 2011

[18]岷县黑裘皮羊微卫星遗传多样性分析. 张瑞,郎侠,吴建平,刘婷,宫旭胤,王彩莲,迟浩斌,梁婷玉. 2019

[19]ISSR荧光标记毛细管电泳与谷子品种遗传多样性分析. 常玉卉,张艾英,刘盼,张莉. 2017

[20]大口黑鲈3个养殖群体的遗传多样性分析. 孙成飞,谢汶峰,胡婕,董浚键,田园园,吴灶和,叶星. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序