青海省小麦品种基于55K SNP芯片的遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 谢静敏

作者： 谢静敏;侯万伟;张小娟

作者机构：

关键词： 青海省;小麦;55K SNP;遗传多样性

期刊名称： 麦类作物学报

ISSN： 1009-1041

年卷期： 2022 年 42 卷 011 期

页码： 1343-1350

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为研究青海省小麦品种之间的遗传关系和遗传多样性,选取93个青海小麦品种,基于55KSNP芯片对其进行全基因组扫描,并进行遗传多样性分析.结果共扫描到53 063个SNP位点,选择分型成功率(call rate,CR)≥0.90、缺失率<10%、MAF>0.05的SNP位点,获得多态性SNP位点50 243个,多态性比率为94.68%.其中多态性位点在第2同源群中分布最多,在第4同源群中分布最少,在基因组中分布呈现B>A>D,特别是4D染色体上的多态性SNP分布最少.93个小麦品种的多态性信息含量(PIC)为0.00~0.59,平均值为0.33,为中度多态性位点;两两品种间的遗传距离为0.00~0.67,平均值为0.41.通过聚类分析表明,根据遗传距离可将93个小麦品种划分为8个类群.综上,青海省现有小麦品种的遗传关系较近,需要引进外来品种来丰富青海省小麦品种的遗传多样性,推动小麦品种的选育及研究工作.

分类号： S512.1%S330

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