玉米bZIP转录因子的生物信息学分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 于滔
作者: 于滔;王成波;曹士亮;孙培元
作者机构:
关键词: 玉米;bZIP;转录因子;生物信息学
期刊名称: 黑龙江农业科学
ISSN: 1002-2767
年卷期: 2016 年 04 期
页码: 1-5
摘要: 碱性亮氨酸拉链(Basic leucine zipper,bZIP)转录因子家族是真核生物中分布最为广泛、结构极其保守的家族之一,能够参与多种生物学过程,但有些bZIP转录因子的功能还未知。研究采用生物信息学方法,对一个玉米bZIP转录因子的理化性质、跨膜结构域、疏水性/亲水性、亚细胞定位及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明:该玉米转录因子是一种不稳定的亲水、酸性蛋白,无信号肽序列,无跨膜结构域,亚细胞定位在细胞核上,主要参与信号转导。本研究结果为进一步研究该转录因子功能奠定了基础。
分类号: S513
- 相关文献
[1]bZIP转录因子与植物抗逆性研究进展. 曹红利,岳川,王新超,杨亚军. 2012
[2]烟草NtbZIP038的克隆、鉴定及表达模式分析. 赵泽玉,李志远,孙晋浩,李东徽,解敏敏,陈明丽,龚达平. 2021
[3]柑橘响应溃疡病菌转录因子CsBZIP40的克隆及功能分析. 贾瑞瑞,周鹏飞,白晓晶,陈善春,许兰珍,彭爱红,雷天刚,姚利晓,陈敏,何永睿,李强. 2017
[4]白木香转录因子AsbZIP59的鉴定和表达分析. 张浩,蔡彩虹,朱家红,彭世清,戴好富,梅文莉. 2022
[5]拟南芥花青素合成途径重要转录因子的研究进展. 洪雪,张少斌,徐江,崔月. 2014
[6]玉米逆境胁迫响应基因ZmbZIP15的克隆与抗旱功能分析. 曹丽茹,叶飞宇,庞芸芸,马晨晨,张新,王振华,鲁晓民. 2024
[7]枸杞MYB103转录因子的生物信息学分析. 尹跃,曹有龙,陈晓静,赵建华. 2012
[8]急性T淋巴细胞性白血病关键基因的筛选与验证. 蒋光洁,陈燕华,郭维,张航,邹琳. 2018
[9]一个新的葡萄抗逆转录因子VvERF2基因的In silico克隆及生物信息学分析. 高峰,熊爱生,彭日荷,李贤,蔡斌,薛永,付晓燕. 2008
[10]硒都黑猪NT5C1A基因核心启动子区鉴定及转录因子预测. 任双,吴俊静,彭先文,张志红,周佳伟,梅书棋,乔木,杜志强. 2024
[11]基于RNA-seq技术的茶树CsbHLH62生物信息学分析. 曹丹,金孝芳,马林龙,刘艳丽,郭桂义. 2019
[12]辣椒WOX转录因子家族的鉴定、进化与表达分析. 张烨达,王星,王丽萍,佟静,武占会,高彦魁. 2023
[13]甘蓝型油菜‘沪油15'中两个CBF类转录因子的克隆与分析. 庄静,朱波,金晓芬,彭日荷,乔玉山,章镇,熊爱生,姚泉洪. 2008
[14]软枣猕猴ICE1基因克隆与生物信息学分析. 张庆田,范书田,李昌禹,艾军,秦红艳. 2019
[15]水稻转录因子NF-YB家族的生物信息学分析. 余东,孙志忠,孙学武,谭炎宁,盛夏冰,段美娟,袁定阳. 2018
[16]拟南芥AtOFP8的生物信息学分析及表达分析. 唐尧,张微,尹艳莉,冯鹏,陈宇峰,常缨. 2018
[17]芒果果实bHLH家族转录因子的生物信息学分析. 郑斌,文定青,武红霞,邹明宏,刘恒,王松标,赵巧丽. 2019
[18]海南龙血树4个DcTIFY10转录因子的鉴定和表达分析. 丁旭坡,马纳纳,庞宽壮,蔡彩虹,戴好富,梅文莉. 2019
[19]森林草莓全基因组MADS-box转录因子基因的鉴定及凤梨草莓果实FaMADS1基因克隆. 周厚成,李刚,赵霞,康兆茹,郭蔼光. 2014
[20]杧果转录因子BES1s家族全基因组鉴定及生物信息学分析. 夏煜琪,孙宇,刘志鑫,孙瑞青,杨楠,蒲金基,张贺. 2022
作者其他论文 更多>>
-
基于SNP芯片对96份糯玉米自交系遗传多样性分析
作者:李文跃;于滔;曹士亮;马雪娜;唐贵;高利;杨耿斌
关键词:糯玉米;SNP;类群划分;遗传分析
-
基于机器学习的玉米自交系杂种优势类群研究
作者:曹士亮;张建国;于滔;杨耿斌;李文跃;马雪娜;孙艳杰;韩微波;唐贵;单大鹏
关键词:玉米;机器学习;交叉验证;类群划分;判别分析
-
52份玉米新材料萌发期耐冷性鉴定与评价
作者:马雪娜;于滔;张建国;曹士亮;杨耿斌;李文跃
关键词:玉米;萌发期;耐冷性;主成分分析;聚类分析
-
110份玉米新材料萌发期耐低温性鉴定与评价
作者:于滔;张建国;曹靖生;马雪娜;何长安;曹士亮;李树军;蔡泉;李昕;李思楠;杨耿斌;李文跃
关键词:玉米;耐低温;萌发期;主成分分析;聚类分析
-
黑龙江省鲜食玉米产业发展困境及对策
作者:杨耿斌;于滔;何长安;李文跃;马雪娜;纪春学;曹士亮
关键词:黑龙江;鲜食玉米;产业发展;对策建议
-
萌发期和苗期糯玉米对低温胁迫的生理响应
作者:于滔;张建国;曹靖生;王丽珊;刘长华;杨耿斌;李文跃
关键词:糯玉米;低温胁迫;萌发期;苗期;生理响应
-
玉米自交系萌发期耐盐性鉴定
作者:段雅娟;曹士亮;于滔;李文跃;杨耿斌;王成波;刘宝民;刘长华
关键词:玉米;萌发期;耐盐性;主成分分析;聚类分析